晶体结构的三元复杂DnrK,正定霉素生物合成的甲基转移酶,与产品。
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简颂,Koskiniemi H, Mantsala P,尼米J,施耐德G
晶体结构的三元复杂DnrK,正定霉素生物合成的甲基转移酶,与产品。
生物化学杂志。2004年9月24日;279 (39):41149 - 56。Epub 2004年7月24日。
- PubMed ID
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15273252 (在PubMed]
- 文摘
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最后步骤之一的生物合成中广泛使用的抗肿瘤药物道诺霉素链霉菌属的甲基化是peucetius 4-hydroxyl群四环的环系统。这个反应是催化S-adenosyl-L-methionine-dependent洋红霉素4-O-methyltransferase DnrK。这种酶的晶体结构的三元复杂的绑定产品S-adenosyl-L-homocysteine 4-methoxy-epsilon-rhodomycin T已经决心2.35埃分辨率。DnrK为,子单元显示典型的小分子O-methyltransferases褶皱。结构的识别提供了洞察蒽环霉素衬底和也表明构象变化作为酶的催化循环的一部分。结合配体的位置和姿态是一致的SN2甲基转移的机制。诱变实验在一个假定的催化基础确认DnrK最有可能充当熵的酶率增强主要是由于定向排列和邻近效应。这个对比DnrK机制与其他O-methyltransferases酸/碱催化已被证明是一个重要的贡献率提高。