从致病菌铜绿假单胞菌中提取的丙氨酸消旋酶在1.45 A分辨率下的晶体结构，含有内部和外部的醛定胺形式。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
雷玛格雷斯P, Im H, Dvorak A, Strych U, Benedik M, Krause KL
从致病菌铜绿假单胞菌中提取的丙氨酸消旋酶在1.45 A分辨率下的晶体结构，含有内部和外部的醛定胺形式。
生物化学。2003 12月23日;42(50):14752-61。
- PubMed ID
-
14674749 (PubMed视图］
- 摘要
-
分解代谢丙氨酸消旋酶DadX的结构来自致病菌铜绿假单胞菌，分辨率为1.45 A，是一个二聚体，其中每个单体由两个结构域组成，一个八链的α / β结构域包含PLP辅因子，第二个结构域主要由β链组成。每个结构域的几何形状与嗜热硬脂芽孢杆菌丙氨酸消旋酶非常相似，但结构域之间的旋转大约不同15度。这一变化不会改变活性位点的结构，几乎所有残基都很好地叠加在其中，均方根差为0.86 a。出乎意料的是，DadX的活性位点含有一个客体底物，位于芽孢杆菌结构中观察到的乙酸和丙酸的位置。它被建模为d-赖氨酸，其末端NZ原子与PLP的C4'形成共价键。由于PLP蛋白赖氨酸、Lys33和C4’之间的内部醛定键也被明确观察到，因此在内部和外部反应形式之间似乎存在一种平衡。PLP辅因子采用两种部分占据的构象状态，类似于先前报道的内部和外部醛定配合物。