上限之间的一个复杂结构模拟和mRNA guanylyl转移酶RNA的结构化学限制。
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Hakansson K,威格利DB
上限之间的一个复杂结构模拟和mRNA guanylyl转移酶RNA的结构化学限制。
《美国国家科学院刊S a . 1998年2月17日,95 (4):1505 - 10。
- PubMed ID
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9465045 (在PubMed]
- 文摘
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草履虫bursaria小球藻病毒PBCV-1 mRNA guanylyl转移酶(限制酶)mRNA的复合体帽模拟G(5 ')购买力平价(5 ')G和结晶。水晶属于空间群C2221单位细胞尺寸= 78.4,b = 164.1 a, c = 103.3, 3.1和衍射数据收集使用同步加速器辐射。结构解决了通过分子替换使用每个前面两个域的确定与三磷酸鸟苷酶在复杂的结构。构象是开放对活性部位间隙,和所有接触酶和配位体之间由域1。鸟嘌呤碱基之一是绑定在同一个口袋里利用三磷酸鸟苷。β磷酸配体位置的构象和活性部位赖氨酸的两侧α磷酸。这对亲核取代反应和几何最优曾被发现三磷酸鸟苷的封闭的限制酶的构象形式,其中赖氨酸可guanylylated在治疗过量锰(II)离子。剩下的帽沿守恒的活性部位模拟运行Lys82 Thr83 Asp84 Gly85 Ile86 Arg87主题,第二个鸟嘌呤,对应5 ' RNA基地,是疏水性Ile86不利。配体显示近似2倍对称与分子内氢键之间的2 ',3 '羟基两种核糖的戒指。