人类醣脂类转运蛋白基因(GLTP):组织、转录状态和演化。
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邹X,钟T,林X, Malakhova ML,派克嗯,棕色的再保险
人类醣脂类转运蛋白基因(GLTP):组织、转录状态和演化。
BMC基因组学。2008年2月8日,9:72。doi: 10.1186 / 1471-2164-9-72。
- PubMed ID
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18261224 (在PubMed]
- 文摘
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背景:醣脂类转运蛋白是典型的创始成员的新GLTP总科的一种新颖的构象折叠和醣脂类绑定的主题。目前的调查提供了第一个洞察组织转录状态,系统/ GLTP基因的进化关系。结果:在人类细胞中,单份GLTP基因中发现了染色体11和12。的基因位点11 p15.1 retrogene表现出潜在的几个特性活跃,包括高度同源(大约94%),全长编码序列包含所有关键氨基酸残基参与醣脂类配体。建立每一人类GLTP基因的转录活性,在网上评估,rt - pcr扩增的GLTP成绩单(s)和甲基化分析监管机构CpG岛进行了使用不同的人类细胞。活跃转录被发现12 q24.11 GLTP但11 p15.1 GLTP转录沉默。不同的表达和纯化的GLTP假字显示醣脂类膜间隙转移活动只有12 q24.11 GLTP。系统进化分析表明,5-exon / 4-intron组织模式和编码序列12 q24.11 GLTP therian中高度保守的哺乳动物和其他脊椎动物。直接同源的intronless GLTP基因观察灵长类动物而不是rodentiates, carnivorates, cetartiodactylates,或didelphimorphiates,符合最近的进化发展。结论:结果识别和描述基因负责GLTP表达在人类和提供存在的第一个证据GLTP假基因,虽然展示了严谨的方法需要明确区分transcriptionally-active retrogenes从沉默的假基因。 The results also rectify errors in the Ensembl database regarding the organizational structure of the actively transcribed GLTP gene in Pan troglodytes and establish the intronless GLTP as a primate-specific, processed pseudogene marker. A solid foundation has been established for future identification of hereditary defects in human GLTP genes.