鸟氨酸的失活机理transcarbamoylase Ndelta - (N ' -L-ornithine -Sulfodiaminophosphinyl),一个真正的过渡态类似物吗?晶体结构对催化机理和影响。

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兰利DB,邓普顿医学领域英航,米切尔再保险,煤灰CA

鸟氨酸的失活机理transcarbamoylase Ndelta - (N ' -L-ornithine -Sulfodiaminophosphinyl),一个真正的过渡态类似物吗?晶体结构对催化机理和影响。

生物化学杂志。2000年6月30日;275 (26):20012 - 9。

PubMed ID
10747936 (在PubMed
]
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1.8分辨率晶体结构是报道的大肠杆菌鸟氨酸transcarbamoylase与活跃的导数复杂phaseolotoxin丁香假单胞菌。phaseolicola N(δ)- (N ' -sulfodiaminophosphinyl) -l-ornithine。电子密度表明,复杂的不是一个共价像之前想的加合物。动力学数据证实,N(δ)- (N ' -sulfodiaminophosphinyl) -l-ornithine展品可逆抑制的半衰期约22 h的顺序和离解常数K (D) = 1.6 x 10(-12)米在37摄氏度和pH值8.0。观察到的氢键的手性磷四面体抑制剂是一致的只有R对映体的存在。参数之间的强相互作用也观察到(57)Nepsilon P-N-S弥合氮表明亚氨基的互变异构体(N(δ)- (N ' -sulfodiaminophosphinyl) -l-ornithine存在束缚态。N的一个亚氨基的互变异构体(δ)- (N ' -sulfodiaminophosphinyl) -l-ornithine在结构上类似于提出反应过渡态。因此,我们建议,N(δ)- (N -sulfodiaminophosphinyl) -l-ornithine,拥有三个独特的阻燃剂债券,代表一个真正的过渡态类似物为鸟氨酸transcarbamoylases,符合严格的约束力的动力学观察。

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鸟氨酸carbamoyltransferase链我 P04391 细节