从大肠杆菌GDP-fucose合成酶:结构独特的短链脱氢酶/还原酶家族的成员,在同一催化两种截然不同的反应活性部位。
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萨默斯WS,斯塔尔ML,沙利文外汇
从大肠杆菌GDP-fucose合成酶:结构独特的短链脱氢酶/还原酶家族的成员,在同一催化两种截然不同的反应活性部位。
结构。1998年12月15日,6 (12):1601 - 12。
- PubMed ID
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9862812 (在PubMed]
- 文摘
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背景:。在检查了所有物种,GDP-fucose从GDP-mannose三步反应合成两种酶催化,GDP-mannose 4、6脱水酶和双功能3、5-epimerase-4-reductase名叫GDP-fucose合成酶。在后者方面海藻糖生物合成不同于其他脱氧和双脱氧糖,差向异构酶和还原酶活动的存在作为单独的酶。缺陷GDP-fucose生物合成已经被证明能够影响细菌有节,植物干细胞发展,相关的白细胞粘附缺乏II型人类免疫缺陷。结果:。我们已经确定GDP-fucose合成酶的结构从大肠杆菌2.2一项决议。GDP-fucose合成酶的结构密切相关,UDP-galactose 4-epimerase和远距离地短链脱氢酶/还原酶家族的其他成员。我们也决定了结构的二元复合物GDP-fucose合成酶的底物NADPH及其产品NADP +烟酰胺代数余子式绑定syn和反构象,分别。结论:。 GDP-fucose synthetase binds its substrate, NADPH, in the proper orientation (syn) for transferring the 4-pro-S hydride of the nicotinamide. We have observed a single binding site in GDP-fucose synthetase for the second substrate, GDP-4-keto,6-deoxy-mannose. This implies that both the epimerization and reduction reactions occur at the same site in the enzyme. As is the case for all members of the short-chain family of dehydrogenase/reductases, GDP-fucose synthetase retains the Ser-Tyr-Lys catalytic triad. We propose that this catalytic triad functions in a mechanistically equivalent manner in both the epimerization and reduction reactions. Additionally, the X-ray structure has allowed us to identify other residues that are potentially required for substrate binding and catalysis.