晶体结构的YecO流感嗜血杆菌(HI0319)揭示了甲基转移酶折叠和绑定S-adenosylhomocysteine。
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张Lim K, H, Tempczyk,伯纳德N, Toedt J,霍华德,艾森斯坦E,赫兹伯格O
晶体结构的YecO流感嗜血杆菌(HI0319)揭示了甲基转移酶折叠和绑定S-adenosylhomocysteine。
蛋白质。2001年12月1;45 (4):397 - 407。
- PubMed ID
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11746687 (在PubMed]
- 文摘
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YecO的晶体结构从流感嗜血杆菌(HI0319),蛋白质序列中的注释数据库作为假设,并没有指定一个函数,已经确定为2.2 a分辨率。揭示了一个折叠结构的典型S-adenosyl-L-methionine-dependent (AdoMet)甲基转移酶的酶。此外,加工辅因子,S-adenosyl-L-homocysteine (AdoHcy)绑定到酶,进一步证实HI0319的生化功能及其家庭成员序列。一个活跃的站点精氨酸,免受大部分溶剂,与阴离子,可能一个氯离子,进而与AdoHcy硫原子的相互作用。AdoHcy和附近的蛋白残留描绘一个小solvent-excluded衬底绑定腔体积的162 (3)。腔周围的环境表明,底物分子包含一个疏水的一部分和一个阴离子组。的许多残留定义腔HI0319序列中不变的家庭但不保存在其他甲基转移酶。因此,YecO酶的底物特异性是独一无二的,不同于所有其他的底物特异性甲基转移酶测序。甲基转移酶的酶委员会列表检查提示手动检查10可能基质利用计算机图形学和建议ortho-substituted安息香酸的活性部位。