结构性基础monometalated蛋氨酸氨肽酶的催化。
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结构性基础monometalated蛋氨酸氨肽酶的催化。
《美国国家科学院刊S a . 2006年6月20日;103 (25):9470 - 5。Epub 2006年6月12日。
- PubMed ID
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16769889 (在PubMed]
- 文摘
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甲硫氨酸氨肽酶(MetAP)消除了伴蛋氨酸残留新合成的蛋白质,这是一个目标,抗菌和抗癌药物的发展。可用x射线结构技术,以及其他metalloaminopeptidases,显示一个包含两个相邻二价金属离子的活性部位弥合水分子或氢氧根离子。dimetalated结构的优势导致自然提出机制涉及两种金属离子的催化作用。然而,动力学研究表明,在许多情况下,只有一个金属离子是所需的全部活动。通过限制数量的金属离子在晶体生长过程中,我们已经获得的晶体结构复杂的大肠杆菌MetAP正亮氨酸膦酸酯,过渡态模拟,和只有一个锰(II)离子在活性位点位置指定M1,和三个相关结构相同的复杂的过渡mono-Mn (II)形式di-Mn (II)的形式。一个unliganded结构也解决了。针对的全部动力能力monometalated MetAP,弱得多的结合常数的入住率网站M2与M1网站相比,新确定的结构,我们提出一个修改后的大肠杆菌肽键水解的MetAP机制。我们还表明,结晶dimetalated metallohydrolases可能的形式,在某些情况下,是一个误导性的实验工件,必须采取谨慎当结构生成反应机制的帮助说明或支持structure-aided药物设计工作。