大肠杆菌的helicase-binding领域DnaG引发酶与高度保守的交互单链dna结合蛋白c端地区。
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Naue N, Beerbaum M, Bogutzki schmied P, Curth U
大肠杆菌的helicase-binding领域DnaG引发酶与高度保守的交互单链dna结合蛋白c端地区。
核酸研究》2013年4月,41(8):4507 - 17所示。doi: 10.1093 / nar / gkt107。Epub 2013 2月20。
- PubMed ID
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23430154 (在PubMed]
- 文摘
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在细菌DNA复制,DnaG引发酶和DNA聚合酶III的气单元争夺绑定单链DNA结合蛋白质(单边带),从而促进之间切换启动和伸长。单边带蛋白质起着关键作用的DNA单链DNA代谢通过保护和协调几个重要的蛋白质相互作用。尽管一个交互的单边带引发酶之前已经报道过了,目前还不清楚哪些域两种蛋白质的参与。本研究确定了c端helicase-binding DnaG领域引发酶(DnaG-C)和高度保守的c端地区单边带的互动网站。ConSurf分析,它可以显示数组的保守氨基酸DnaG-C周围形成一个疏水口袋里基本的残留物,让人想起SSB-binding网站其他蛋白质。使用蛋白质交联、定点诱变分析超速离心法和核磁共振光谱,我们证明了这些保守氨基酸残基与单边带参与互动。尽管c端域DnaG引发酶还参与互动DnaB解旋酶,各自的表面结合位点DnaG-C不重叠,单边带氨基端子域名绑定,而DnaB与最终的糖。