结构基因组学的微生物基因高度保守的未知函数寻找新的抗菌靶点。必威国际app
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作为C, Coutard B,伯恩D, Chenivesse年代,克劳德•JB Deregnaucourt C, Fricaux T, Gianesini-Boutreux C, Jeudy年代,Lebrun R,胎盘C, Notredame C,白罗啊,Suhre K, Varagnol M, Claverie JM
结构基因组学的微生物基因高度保守的未知函数寻找新的抗菌靶点。必威国际app
J结构功能基因组学,2003;4 (2 - 3):141 - 57。
- PubMed ID
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14649299 (在PubMed]
- 文摘
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有超过100的抗菌药物在我们处理在1980年代,细菌感染被认为是解决的问题。然而,今天,大多数医院感染是几类抗菌药物不敏感,而致命的金黄色葡萄球菌对万古霉素耐药菌株——最后抗生素——最近开始出现。其他危及生命的微生物,如粪肠球菌和结核分枝杆菌已经能够抵抗每一个可用的抗生素。因此迫切,不断需要新的,最好是large-spectrum,抗菌分子,理想情况下针对新的生化途径。我们进度报告结构基因组学计划针对新抗菌基因的发现目标在无特征函数的进化保守的基因。一系列的生物信息学和比较基因组学分析是用来确定一组221个候选基因的常见革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌。这些基因在两个实验室之间的分裂。他们现在提交给系统的三维结构测定协议包括克隆、蛋白表达和纯化、结晶、x射线衍射、结构解释和功能预测。我们在这里描述的策略处理的111个基因在我们的实验室。生物信息学最多使用阶段的生产过程,处理的111个基因,17个月到项目,108年被成功克隆,103人表现出可检测表达,84年导致可溶性蛋白质的生产,46纯化,12导致可用的晶体,和7结构已经确定。