在大肠杆菌合成aspartyl-tRNA (Asp)——第二步的快照。

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艾勒年代,Dock-Bregeon Moulinier L,蒂埃里JC,莫拉D

在大肠杆菌合成aspartyl-tRNA (Asp)——第二步的快照。

EMBO j . 1999年11月15日,18 (22):6532 - 41。

PubMed ID

10562565 (在PubMed

]

文摘

大肠杆菌的晶体结构2.4 aspartyl-tRNA合成酶(AspRS) tRNA (Asp) -aspartyl-adenylate复杂显示了两个基板准备转让的天冬氨酸基腺苷酸的3 '羟基终端tRNA的腺苷。提出了一个通用的分子机制的第二步aspartylation反应占观察到的构象变化,特别是活性部位的口袋里。过渡态的稳定主要是通过两个氨基酸:介导的二类不变的主题2的精氨酸和eubacterial-specific Gln231,在真核生物和古菌是取代结构异源丝氨酸。交互是观察到的两种典型的rna蛋白质模式:反密码子茎环结构,包括摆动基地Q,结合氨基beta-barrel域通过直接protein-RNA交互,而受体的结合干细胞涉及直接和water-mediated氢键在最初的识别方案。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
天冬氨酸	天冬氨酸——tRNA连接酶,胞质	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节
天冬氨酸	天冬氨酸——tRNA连接酶、线粒体	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节