建设和描述的完全length-enriched和5 ' -end-enriched cDNA文库。
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铃木Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama, Sugano年代
建设和描述的完全length-enriched和5 ' -end-enriched cDNA文库。
基因。1997年10月24日,200 (2):149 - 56。
- PubMed ID
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9373149 (在PubMed]
- 文摘
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使用“oligo-capped”信使rna (Maruyama, K。、Sugano年代。,1994年。Oligo-capping:一个简单的方法来取代与oligoribonucleotides真核mrna的帽结构。基因138个,171 - 174年),他的帽子结构被合成寡核苷酸所取代,我们构造的两种类型的互补脱氧核糖核酸库。一个是“充分length-enriched cDNA文库”高含量的全长cDNA克隆,另一个是“5”-end-enriched cDNA文库”,与他们的mRNA有高含量的cDNA克隆网站开始。5 ' -end-enriched图书馆建于特别是孤立长mRNA的mRNA开始网站。为了描述这些库,我们进行了一次通过的随机选择的cDNA克隆测序两库(84为全length-enriched cDNA克隆库和159为5 ' -end-enriched cDNA克隆库)。cDNA克隆的多肽链延长因子1α是最常见的克隆(9)隔离,其中超过80%(8克隆)含有基因的mRNA开始网站。此外,约80%的cDNA克隆这两个库的序列与已知基因的5’结束或上游序列已知的5 '末端(28 35的完整length-enriched图书馆和51 62 5 ' -end-enriched库)。最长的长篇克隆完整length-enriched cDNA文库的约3300个基点(28中克隆)。相比之下,七个克隆(51克隆的mRNA开始网站)从5 ' -end-enriched cDNA库来自mRNA的长度超过3500个基点。 These cDNA libraries may be useful for generating 5' ESTs with the information of the mRNA start sites that are now scarce in the EST database.