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核糖霉素

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核糖霉素是世卫组织人类药物关键抗微生物药物清单上的一种广谱氨基糖苷类抗生素。

通用名称
核糖霉素
药物库登录号
DB03615
背景

核霉素是一种氨基糖苷类抗生素1隔绝链霉菌属ribosidificus2被列为世界卫生组织极其重要的抗微生物药物之一。3.

类型
小分子
组
批准,实验
结构
 3 d
类似的结构
重量
平均:454.4727
单一同位素的:454.227493328
化学公式
C17H34N4O10
同义词
  • Ribostamicina
  • 核糖霉素
  • 核糖霉素一
  • Ribostamycine
  • Ribostamycinum
  • 核糖霉素
外部id
  • 抗生素SF 733
  • 部1709年
  • sf - 733

药理学

指示

不可用

降低药物开发失败率
构建、训练和验证机器学习模型
基于证据和结构化的数据集。
看看
使用结构化数据集构建、训练和验证预测机器学习模型。
看看
禁忌症和黑盒子警告
避免危及生命的药物不良事件
提高临床决策支持的信息禁忌症和黑箱警告，人口限制，有害的风险，等等。
了解更多
避免危及生命的药物不良事件，提高临床决策支持。
了解更多
药效学

不可用

作用机制

氨基糖苷类通过与细菌30S核糖体亚基结合起作用(有些通过与50S亚基结合起作用)，抑制肽基- trna从a位点到p位点的易位，也导致mRNA的误读，使细菌无法合成对其生长至关重要的蛋白质。然而，它们的确切作用机制还不完全清楚。

目标 行动 生物
U蛋白质disulfide-isomerase 不可用 人类
U30S核糖体蛋白S12 不可用 大肠杆菌(菌株K12)
U氨基糖苷N(6')-乙酰转移酶1型 不可用 肠炎沙门氏菌
U氨基糖苷类2》-N-acetyltransferase 不可用 结核分枝杆菌
吸收

不可用

配送量

不可用

蛋白结合

不可用

新陈代谢
不可用
淘汰路线

不可用

半衰期

不可用

间隙

不可用

的不利影响
改进决策支持和研究结果必威国际app
有结构化的不良反应数据，包括:黑箱警告，不良反应，警告和预防措施，以及发病率。
了解更多
利用我们结构化的不良反应数据改善决策支持和研究结果。必威国际app
了解更多
毒性

不可用

通路
不可用
药物基因组学效应/ adrBrowse all" title="" id="snp-actions-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
不可用

的相互作用

药物的相互作用Learn More" title="" id="structured-interactions-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
在没有医疗保健提供者的帮助下，不应解释此信息。如果您认为自己正在经历互动，请立即与医疗保健提供者联系。没有交互作用并不一定意味着不存在交互作用。
药物 交互
整合药物之间
软件中的交互
Abacavir 阿巴卡韦可降低核霉素的排泄率，从而导致血清核霉素水平升高。
Aceclofenac 乙酰氯芬酸可降低核霉素排泄率，导致血清核霉素水平升高。
Acemetacin 阿西美辛可降低核糖霉素排泄率，导致血清核糖霉素水平升高。
苊香豆醇 当核霉素与阿辛诺豆蔻醇联合使用时，出血的风险或严重程度可增加。
对乙酰氨基酚 对乙酰氨基酚可降低核霉素的排泄率，从而导致血清核霉素水平升高。
乙酰胆碱 乙酰胆碱与核霉素合用可降低疗效。
Acetyldigitoxin 当核霉素与乙酰洋地黄联合使用时，不良反应的风险或严重程度可增加。
乙酰水杨酸 乙酰水杨酸可降低核霉素排泄率，导致血清核霉素水平升高。
Aclidinium 阿克利定可降低核霉素排泄率，导致血清核霉素水平升高。
Acrivastine 吖啶伐他汀可降低核霉素的排泄率，从而导致血清核霉素水平升高。
识别潜在的用药风险
轻松比较多达40种药物与我们的药物相互作用检查。
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食物相互作用
不可用

产品

来自全球10多个地区的药品信息
我们的数据集提供批准的产品信息，包括:
剂量，形式，标签，给药途径和上市期限。
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产品的成分
成分 UNII 中科院 InChI关键
硫酸核糖霉素 QFN1QU7PEN 53797-35-6 RTCDDYYZMGGHOE-YMSVYGIHSA-N

类别

ATC代码
核霉素
药物类别
化学分类所提供的Classyfire
描述
这种化合物属于一类有机化合物，称为4,5-二取代2-脱氧链胺。这些是2-脱氧链胺氨基糖苷，糖苷与呋喃糖单位的吡喃糖在C4-和c5位置相连。
王国
有机化合物
超类
有机氧化合物
类
Organooxygen化合物
子课
碳水化合物和碳水化合物缀合物
直接父
4, 5-disubstituted 2-deoxystreptamines
选择父母
O-glycosyl化合物/氨基环醇及其衍生物/环己胺/环己醇/环氧乙烷/单糖/四氢呋喃/1, 2-aminoalcohols/Oxacyclic化合物/缩醛树脂
再看4个
基
1, 2-aminoalcohol/4, 5-disubstituted 2-deoxystreptamine/缩醛/酒精/脂肪族杂单环化合物/胺/氨基环糖醇或衍生物/循环酒精/环糖醇或其衍生物/环己醇
显示16个
分子框架
脂肪族杂单环化合物
外部描述符
氨基糖苷类抗生素，氨基环糖醇糖苷(CHEBI: 45257）
受影响的生物
  • 人类和其他哺乳动物
  • 肠道细菌和其他真细菌

化学标识符

UNII
2 q5jou7t53
化学文摘号
25546-65-0
InChI关键
NSKGQURZWSPSBC-VVPCINPTSA-N
InChI
InChI = 1 s / C17H34N4O10 / c18-2-6-10 (24) 12 (26) 8 (21) 16 (28-6) 30-14-5 (20) 1 - 4 (19) 9 (23) 15 (14) 31-17-13 (27) 11 (25) 7 (3-22) 29-17 / h4-17 22-27H, 1 - 3, 18-21H2 / t4 -, 5 + 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12、13、14、15、16、17 + / m1 / s1
国际命名
(2 r, 3 s, 4 r, r, 5 6 r) 5-amino-2 -(氨甲基)6 - {((1 r, 2 r, 3 s, 4 r, 6 s) 4, 6-diamino-2 - {((2 s, 3 r, 4 s, 5 r) 3, 4-dihydroxy-5 -(羟甲基)oxolan-2-yl]氧}3-hydroxycyclohexyl)氧}oxane-3, 4-diol
微笑
[H] [C@@] 1 (O [C@@H] 2 [C@@H] (O) [C@H] (N) C [C@H] (N) [C@H] 2 [C@H] 2 O [C@H] (CN) [C@@H] (O) [C@H] (O) [C@H] 2 N) O (C@H) (CO) [C@@H] (O) [C@H] 1 O

参考文献

合成参考

秋田Eiichi，土屋Tsutomu，近藤新一，安田俊太郎，Sumio mezawa, Hamao mezawa，“1-N-((S)-。alpha.-取代-。omega.-氨基酰基)-neamine或-核霉素及其生产。”美国专利US4008218, 1974年2月发布。

 US4008218
一般引用
  1. Baud H, Betencourt A, Peyre M, Penasse L:核霉素在新霉素生物合成中的中间体。J Antibiot(东京)。1977年9月,30(9):720 - 3。doi: 10.7164 / antibiotics.30.720。［文章］
  2. Zachman-Brockmeyer TR, Thoden JB, Holden HM:核糖链霉菌RbmB的结构，一种参与核霉素生物合成的转氨酶。中国生物工程学报，2017年9月26日(9):1886-1892。doi: 10.1002 / pro.3221。Epub 2017 7月23日。［文章］
  3. 世卫组织:对人类医学至关重要的抗微生物药物第六版[链接］
KEGG药物
D08478
KEGG化合物
C01759
PubChem化合物
33042
PubChem物质
46505351
ChemSpider
30581
ChEBI
45257
ChEMBL
CHEMBL221572
锌
ZINC000053255716
治疗靶点数据库
DNC001211
PDBe配体
里约热内卢
维基百科
核糖霉素
PDB项
1 m4g/1 s3z/输送量大2/2 et5/2 fcz/2 kxm/2 n0j/3 c3z/3 dvv/5 iqd.．.
再展示3个

临床试验

临床试验Learn More" title="" id="clinical-trials-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
阶段 状态 目的 条件 数

药物经济学

制造商
不可用
外包商
不可用
剂型
形式 路线 强度
胶囊
价格
不可用
专利
不可用

属性

状态
固体
实验属性
财产 价值 源
熔点(°C) 193.5°C PhysProp
pKa 7.7 默克指数(1996)
预测性能
财产 价值 源
水溶度 88.7毫克/毫升 ALOGPS
logP -2.9 ALOGPS
logP -6.4 ChemAxon
日志 -0.71 ALOGPS
pKa(最强酸性) 12.19 ChemAxon
pKa(最强基础) 9.67 ChemAxon
生理上的电荷 4 ChemAxon
氢受体计数 14 ChemAxon
氢供体数量 10 ChemAxon
极表面积 262.382 ChemAxon
可旋转键数 6 ChemAxon
折射性 100.17米3.·摩尔－1 ChemAxon
极化率 44.93. ChemAxon
环数 3. ChemAxon
生物利用度 0 ChemAxon
五原则 没有 ChemAxon
Ghose用过滤器 没有 ChemAxon
Veber法则 没有 ChemAxon
MDDR-like规则 是的 ChemAxon
ADMET预测特征
财产 价值 概率
人体肠道吸收 - 0.8617
血脑屏障 - 0.9659
Caco-2渗透 - 0.7502
22基板 Non-substrate 0.5164
p -糖蛋白抑制剂I Non-inhibitor 0.8023
p -糖蛋白抑制剂II Non-inhibitor 0.8764
肾有机阳离子转运体 Non-inhibitor 0.7886
CYP450 2C9底物 Non-substrate 0.8231
CYP450 2D6衬底 Non-substrate 0.8041
CYP450 3A4衬底 Non-substrate 0.6473
CYP450 1A2底物 Non-inhibitor 0.9157
CYP450 2C9抑制剂 Non-inhibitor 0.9147
CYP450 2D6抑制剂 Non-inhibitor 0.9231
CYP450 2C19抑制剂 Non-inhibitor 0.9034
CYP450 3A4抑制剂 Non-inhibitor 0.9471
CYP450抑制性乱交 低CYP抑制性乱交 0.8446
艾姆斯测试 非AMES毒性 0.6934
致癌性 Non-carcinogens 0.9505
生物降解 未准备好生物可降解 0.8587
大鼠急性毒性 1.4850 LD50, mol/kg 不适用
hERG抑制(预测因子I) 弱的抑制剂 0.9728
hERG抑制(预测因子II) Non-inhibitor 0.81
ADMET数据预测使用admetSAR，一个用于评估化学ADMET性能的免费工具。（23092397）

光谱

质谱仪(NIST)
不可用
光谱
光谱 光谱类型 飞溅的关键
预测MS/MS谱- 10V，阳性(标注) 预测质/女士 不可用
预测质谱- 20V，阳性(带注释) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 40V，阳性(标注) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 10V，阴性(标注) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 20V，阴性(标注) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 40V，阴性(标注) 预测质/女士 不可用

目标

建立、预测和验证机器学习模型
使用我们的结构化和基于证据的数据集开启新
洞察和加速药物研究。必威国际app
了解更多
使用我们的结构化和循证数据集来解锁新的见解并加速药物研究。必威国际app
了解更多
细节 1.蛋白质disulfide-isomerase
种类
蛋白质
生物
人类
药理作用
未知的
通用函数
蛋白质异源二聚活性
特定的功能
这种多功能蛋白质催化二硫键的形成、断裂和重排。在细胞表面，似乎是一种还原酶，它能切割蛋白质的二硫键。
基因名字
P4HB
Uniprot ID
P07237
Uniprot名字
蛋白质disulfide-isomerase
分子量
57115.795哒
参考文献
  1. Horibe T, Nagai H, Sakakibara K, Hagiwara Y, Kikuchi M:核糖霉素抑制蛋白二硫异构酶伴侣活性。生物化学与生物物理学报。2001年12月21日;289(5):967-72。［文章］
细节 2.30S核糖体蛋白S12
种类
蛋白质
生物
大肠杆菌(菌株K12)
药理作用
未知的
通用函数
Trna绑定
特定的功能
S4和S5在翻译精度方面起着重要作用。与参与tRNA选择的16S rRNA碱基相互作用并稳定在A位点和mRNA主干。瞧……
基因名字
rpsL
Uniprot ID
P0A7S3
Uniprot名字
30S核糖体蛋白S12
分子量
13736.995哒
细节 3.氨基糖苷N(6')-乙酰转移酶1型
种类
蛋白质
生物
肠炎沙门氏菌
药理作用
未知的
通用函数
蛋白质同二聚体活性
特定的功能
催化一个乙酰基从乙酰辅酶a转移到氨基糖苷分子的6'-氨基上，从而对含有紫癜胺环的抗生素(包括阿米卡星)产生耐药性。
基因名字
不可用
Uniprot ID
Q9R381
Uniprot名字
氨基糖苷N(6')-乙酰转移酶1型
分子量
16361.42哒
细节 4.氨基糖苷类2》-N-acetyltransferase
种类
蛋白质
生物
结核分枝杆菌
药理作用
未知的
通用函数
可能催化辅酶a依赖乙酰化的2'羟基或氨基的广谱氨基糖苷和赋予抗性氨基糖苷(通过相似性)。体外试验显示对氨基糖苷类药物的耐药性没有显著增加，可能是由于在异种系统中低表达(PubMed:9159528)。
特定的功能
氨基糖苷2'-n-乙酰转移酶活性
基因名字
aac格式
Uniprot ID
P9WQG9
Uniprot名字
氨基糖苷类2》-N-acetyltransferase
分子量
20037.53哒

酶

细节 1.氨基糖苷类2》-N-acetyltransferase
种类
蛋白质
生物
结核分枝杆菌
药理作用
未知的
行动
底物
通用函数
可能催化辅酶a依赖乙酰化的2'羟基或氨基的广谱氨基糖苷和赋予抗性氨基糖苷(通过相似性)。体外试验显示对氨基糖苷类药物的耐药性没有显著增加，可能是由于在异种系统中低表达(PubMed:9159528)。
特定的功能
氨基糖苷2'-n-乙酰转移酶活性
基因名字
aac格式
Uniprot ID
P9WQG9
Uniprot名字
氨基糖苷类2》-N-acetyltransferase
分子量
20037.53哒
参考文献
  1. Vong K, Auclair K:了解和克服N-6'-乙酰转移酶引起的氨基糖苷类耐药。中国生物化学杂志，2012年4月1日;3(4):397-407。doi: 10.1039 / C2MD00253A。［文章］
  2. Zarate SG, De la Cruz Claure ML, benato - arenas R, Revuelta J, Santana AG, Bastida A:克服氨基糖苷酶耐药:新型抗生素和抑制剂的设计。分子。2018年1月30日;23(2)。pii: molecules23020284。doi: 10.3390 / molecules23020284。［文章］
  3. 石凯，方德华，冯辉，等。氨基糖苷激酶介导的抗生素耐药研究进展。前细胞感染微生物。2013年6月25日;3:22。doi: 10.3389 / fcimb.2013.00022。eCollection 2013。［文章］

药物创建于2005年6月13日13:24 /更新于2021年2月21日18:51