识别

总结

阿泊拉霉素是一种兽药用氨基糖苷类抗生素,用于治疗动物感染。

通用名称
阿泊拉霉素
DrugBank加入数量
DB04626
背景

阿普霉素是一种氨基糖苷类抗生素,对许多革兰氏阴性菌有杀菌作用。阿普霉素是一种结构独特的抗生素,包含一个双环糖部分和一个单取代脱氧链霉素。它还没有被批准用于人体。

类型
小分子
实验,审查批准
结构
重量
平均:539.5771
单一同位素的:539.280257179
化学公式
C21H41N5O11
同义词
  • (四点)- (8 r 2-amino-8-o——(4-amino-4-deoxy -α-D-glucopyranosyl) 2、3,7-trideoxy-7 - (methylamino) -D-glyceroα-D-allo-octodialdo-1, 8, 4-dipyranos-1-yl) 2-deoxy-d-streptamine
  • 四点(3α-amino-6α- ((4-amino-4-deoxy -α-D-glucopyranosyl)氧)2,3,4,5β,6,7,8,8个α-octahydro-8β-hydroxy-7β- (methylamino) pyrano (2 b) pyran-2α- yl) 2-deoxy-d-streptamine
  • Apramicina
  • 阿泊拉霉素
  • Apramycine
  • Apramycinum
  • 暗霉素二世
外部id
  • el - 857

药理学

指示

用于治疗动物体内的细菌感染。

降低药物开发失败率
构建、训练和验证机器学习模型
通过基于证据和结构化的数据集。
看看
使用结构化数据集构建、训练和验证预测性机器学习模型。
看看
禁忌症和黑箱警告
避免危及生命的不良药物事件
改进临床决策支持的信息禁忌症和黑箱警告,人口限制,有害风险,等等。
了解更多
避免危及生命的药物不良事件,提高临床决策支持。
了解更多
药效学

不可用

的作用机制

在氨基糖苷类药物中,阿普霉素的作用机制是基于阻断易位和结合真核解码位点的能力,尽管细菌靶点识别阿普霉素所需的关键残基存在差异。这种药物结合在RNA的深沟槽中,形成一个连续堆叠的螺旋,包括非典型的C.A和G.A碱基对和一个凸起的腺嘌呤。阿普霉素在人类解码位点RNA上的结合模式与细菌靶向的氨基糖苷识别模式不同,提示了阿普霉素在真核生物和细菌中的作用的分子基础。

目标 行动 生物
U16 s rrna 不可用 肠道细菌和其他真细菌
吸收

不可用

的体积分布

不可用

蛋白结合

不可用

新陈代谢
不可用
路线的消除

不可用

半衰期

不可用

间隙

不可用

的不利影响
改善决策支持和研究成果必威国际app
有结构化的不良反应数据,包括:黑箱警告,不良反应,警告和预防措施,发生率。
了解更多
利用我们结构化的不良影响数据改善决策支持和研究结果。必威国际app
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毒性

不可用

通路
不可用
药物基因组学效应/ adrBrowse all" title="" id="snp-actions-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
不可用

的相互作用

药物的相互作用Learn More" title="" id="structured-interactions-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
没有医疗保健提供者的帮助,不应解释此信息。如果您认为您正在经历交互,请立即与医疗保健提供者联系。没有交互并不一定意味着没有交互存在。
药物 交互
Abacavir 阿普霉素可降低阿巴卡韦的排泄率,导致血清水平升高。
Aceclofenac 当阿普霉素与醋酸氯芬酸合用时,肾毒性的风险或严重程度会增加。
Acemetacin 当阿普霉素与阿西美辛合用时,肾毒性的风险或严重程度会增加。
苊香豆醇 当阿普霉素与针叶香豆醇合用时,出血的风险或严重程度会增加。
对乙酰氨基酚 阿普霉素可降低对乙酰氨基酚的排泄率,导致血清中乙酰氨基酚含量升高。
乙酰胆碱 乙酰胆碱与阿普霉素合用可降低疗效。
Acetyldigitoxin 当阿普霉素与乙酰地地黄毒素合用时,不良反应的风险或严重程度会增加。
乙酰水杨酸 当乙酰水杨酸与阿普霉素合用时,肾毒性的风险或严重程度会增加。
Aclidinium 阿普霉素可降低阿克立宁的排泄率,从而提高血清中阿克立宁的水平。
Acrivastine 阿普霉素可降低吖伐他汀的排泄率,导致血清中吖伐他汀含量升高。
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食物相互作用
不可用

产品

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产品的成分
成分 UNII 中科院 InChI关键
硫酸阿泊拉霉素 8 uyl6naz3q 65710-07-8 不适用

类别

药物类别
化学分类所提供的Classyfire
描述
这种化合物属于氨基环醇糖苷类有机化合物。这些有机化合物含有氨基环醇部分糖苷与碳水化合物部分相连。含有2-链胺核心的氨基糖苷主要有两类。它们被称为4,5-和4,6-二取代2-脱氧链胺。
王国
有机化合物
超类
有机氧化合物
Organooxygen化合物
子课
碳水化合物和碳水化合物共轭物
直接父
Aminocyclitol苷
选择父母
己糖/Aminocyclitols和衍生品/环己胺/环己醇/环氧乙烷/1, 3-aminoalcohols/1, 2-aminoalcohols/Oxacyclic化合物/二烃基胺/缩醛树脂
显示4个
1, 2-aminoalcohol/1, 3-aminoalcohol/缩醛/酒精/脂肪族heteropolycyclic化合物//氨基cyclitol糖苷/Aminocyclitol或衍生品/循环酒精/Cyclitol或衍生品
显示17
分子框架
脂肪族heteropolycyclic化合物
外部描述符
有机杂双环化合物氨基糖苷2-脱氧链丙胺衍生物(CHEBI: 2790
受影响的生物
  • 肠道细菌和其他真细菌

化学标识符

UNII
388年k3tr36z
化学文摘号
37321-09-8
InChI关键
XZNUGFQTQHRASN-XQENGBIVSA-N
InChI
InChI = 1 s / C21H41N5O11 c1-26-11-14(30) 18-8(33-20(11) 37-21-16(32) 13(29) 10(25) 9(速率)34-21)3 - 7 (24)19 (36-18)35-17-6 (23)2 - 5 (22)12 (28)15 (17)31 / h5-21 26-32H, 2 - 4, 22-25H2, 1 h3 / t5 - 6 + 7 - 8 + 9 - 10 - 11 + 12 + 13 +, 14、15、16、17、18 + 19 + 20 - 21 - m1 / s1
国际命名
(2 r, 3 r, 4 s, 5 s, 6 s) 2 - {((2 r, 3 s, 4 r, 4, 6, 7, 8,) 7-amino-6 - {((1 r, 2 r, 3 s, 4 r, 6 s) 4, 6-diamino-2, 3-dihydroxycyclohexyl)氧}4-hydroxy-3——(methylamino) -octahydropyrano[3、2 b] pyran-2-yl]氧}5-amino-6 -(羟甲基)oxane-3 4-diol
微笑
CN [C@H] 1 [C@@H] (O) [C@H] 2 O [C@H] (O [C@@H] 3 [C@@H] (N) C [C@@H] (N) [C@H] (O) [C@H] 3 O) [C@H] (N) C [C@@H] 2 O [C@@H] 1 [C@H] 1 O [C@H] (CO) [C@@H] (N) [C@H] (O) [C@H] 1 O

参考文献

合成参考

富田浩司,筑浦浩史,川口浩史,“阿普霉素和内布拉霉素因子V’的发酵过程”。美国专利US4032404, 1974年12月发布。

US4032404
一般引用
  1. Hermann T, Tereshko V, Skripkin E, Patel DJ:人核糖体解码位点对阿普霉素的识别。《血细胞分子杂志》2007 5 - 6;38(3):193-8。Epub 2007年1月29日。[文章
  2. Kondo J, Francois B, Urzhumtsev A, Westhof E:阿普霉素复合的智人细胞质核糖体解码位点的晶体结构。Angew Chem Int Ed Engl. 2006 5月12日;45(20):3310-4。[文章
  3. 韩强,赵强,张丽娟,张丽娟,张丽娟,张丽娟,张丽娟,张丽娟,张丽娟,张丽娟:apramycin-RNA复合体中糖苷伪碱基对和三元组的分子识别。Angew Chem Int Ed Engl. 2005 4月29日;44(18):2694-700。[文章
KEGG药物
D02322
KEGG化合物
C01555
PubChem化合物
3081545
PubChem物质
46509143
ChemSpider
2339128
ChEBI
2790
ChEMBL
CHEMBL1230961
ZINC000008214486
治疗目标数据库
DNC000243
PDBe配体
AM2
维基百科
阿泊拉霉素
PDB项
1 yrj/2 g5k/2 m4q/2 oe5/2 oe8/4尔/4 k31/6 mn4/7 jm2系列/7凯斯...
8展示更多
化学物质
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临床试验

临床试验Learn More" title="" id="clinical-trials-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
阶段 状态 目的 条件
1 完成 基础科学 健康受试者(HS) 1
1 没有招聘 治疗 细菌感染 1

药物经济学

制造商
不可用
外包商
不可用
剂型
形式 路线 强度
口服
粉,为解决方案 口服
价格
不可用
专利
不可用

属性

状态
固体
实验属性
财产 价值
pKa 8.5 默克索引(1996)
预测性能
财产 价值
水溶度 53.3毫克/毫升 ALOGPS
logP -2.8 ALOGPS
logP -6.5 ChemAxon
日志 -1 ALOGPS
pKa最强(酸性) 12.29 ChemAxon
pKa最强(基本) 9.53 ChemAxon
生理上的电荷 5 ChemAxon
氢受体数 16 ChemAxon
氢供体数 11 ChemAxon
极地表面面积 283.642 ChemAxon
可旋转键数 6 ChemAxon
折射性 120.91米3.·摩尔-1 ChemAxon
极化率 54.463. ChemAxon
数量的戒指 4 ChemAxon
生物利用度 0 ChemAxon
五个原则 没有 ChemAxon
Ghose用过滤器 没有 ChemAxon
Veber法则 没有 ChemAxon
MDDR-like规则 是的 ChemAxon
预测ADMET特性
财产 价值 概率
人类肠道吸收 - 0.8007
血脑屏障 - 0.9898
Caco-2渗透 - 0.7556
22基板 底物 0.568
我22抑制剂 Non-inhibitor 0.8164
22抑制剂二世 Non-inhibitor 0.9619
肾脏有机阳离子转运蛋白 Non-inhibitor 0.885
CYP450 2 c9衬底 Non-substrate 0.7737
CYP450 2 d6衬底 Non-substrate 0.8285
CYP450 3 a4衬底 Non-substrate 0.544
CYP450 1 a2衬底 Non-inhibitor 0.9045
CYP450 2 c9抑制剂 Non-inhibitor 0.9196
CYP450 2 d6抑制剂 Non-inhibitor 0.9231
CYP450 2 c19抑制剂 Non-inhibitor 0.9025
CYP450 3 a4酶抑制剂 Non-inhibitor 0.9234
CYP450抑制滥交 低CYP抑制性乱交 0.8708
艾姆斯测试 艾姆斯有毒 0.5193
致癌性 Non-carcinogens 0.9671
生物降解 没有准备好可生物降解 0.9023
大鼠急性毒性 2.2488 LD50,摩尔/公斤 不适用
hERG抑制(预测因子I) 弱的抑制剂 0.9812
hERG抑制(预测因子II) Non-inhibitor 0.8385
ADMET数据预测使用admetSAR,一个评估化学ADMET性质的免费工具。(23092397

光谱

质量规范(NIST)
不可用
光谱
光谱 光谱类型 飞溅的关键
预测MS/MS谱- 10V,阳性(带注释) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 20V,阳性(带注释) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 40V,阳性(带注释) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 10V,阴性(带注释) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 20V,阴性(带注释) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 40V,阴性(带注释) 预测质/女士 不可用

目标

建立、预测和验证机器学习模型
使用我们的结构化和循证数据集开启新
洞察和加速药物研究。必威国际app
了解更多
利用我们的结构化和循证数据集,解锁新的见解,加速药物研究。必威国际app
了解更多
种类
核苷酸
生物
肠道细菌和其他真细菌
药理作用
未知的
在原核生物中,16S rRNA对于识别mRNA的5'端并将其正确定位在核糖体上至关重要。16S rRNA有一个特殊的二级结构,其中一半的核苷酸是碱基配对的。16S rRNA序列具有高度保守性,常用于进化和物种比较分析。
参考文献
  1. Woodcock J, Moazed D, Cannon M, Davies J, Noller HF:抗生素与16S核糖体RNA中A-和p位点特异性碱基的相互作用。EMBO J. 1991 10月10(10):3099-103。[文章
  2. Kondo J, Francois B, Urzhumtsev A, Westhof E:含氨基糖苷的智人核糖体解码A位点的晶体学研究。核酸符号Ser (Oxf)。(49): 253 2005; 4。[文章

药物创建于2007年9月11日17:49 /更新于2021年6月12日10:53