识别

通用名称
Tagetitoxin
药物库登录号
DB04788
背景

Tagetitoxin是一种细菌植物毒素。它优先抑制真核RNA聚合酶。

类型
小分子
实验
结构
重量
平均:416.298
单一同位素的:416.029066598
化学公式
C11H17N2O11PS
同义词
  • (1 r, 4 r、5 r, r 6, 7, 8 r) 6-acetoxy-7-amino-4-carbamoyl-4-hydroxy-8——(phosphonooxy) 9-oxa-3-thiabicyclo (3.3.1) nonane-1-carboxylic酸

药理学

指示

不可用

降低药物开发失败率
构建、训练和验证机器学习模型
基于证据和结构化的数据集。
看看
使用结构化数据集构建、训练和验证预测机器学习模型。
看看
禁忌症和黑盒子警告
避免危及生命的药物不良事件
提高临床决策支持的信息禁忌症和黑箱警告,人口限制,有害的风险,等等。
了解更多
避免危及生命的药物不良事件,提高临床决策支持。
了解更多
药效学

不可用

作用机制

Tagetitoxin抑制所有RNAP催化反应。Tagetitoxin的结合完全是通过与β和β '残基的极性相互作用介导的,这些残基的取代在体外对Tagetitoxin具有抗性。

目标 行动 生物
Udna定向RNA聚合酶亚基β 不可用 嗜热热杆菌(HB8 / ATCC 27634 / DSM 579菌株)
Udna定向RNA聚合酶亚基β ' 不可用 嗜热热杆菌(HB8 / ATCC 27634 / DSM 579菌株)
吸收

不可用

配送量

不可用

蛋白结合

不可用

新陈代谢
不可用
淘汰路线

不可用

半衰期

不可用

间隙

不可用

的不利影响
改进决策支持和研究结果必威国际app
有结构化的不良反应数据,包括:黑箱警告,不良反应,警告和预防措施,以及发病率。
了解更多
利用我们结构化的不良反应数据改善决策支持和研究结果。必威国际app
了解更多
毒性

不可用

通路
不可用
药物基因组学效应/ adrBrowse all" title="" id="snp-actions-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
不可用

的相互作用

药物的相互作用Learn More" title="" id="structured-interactions-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
在没有医疗保健提供者的帮助下,不应解释此信息。如果您认为自己正在经历互动,请立即与医疗保健提供者联系。没有交互作用并不一定意味着不存在交互作用。
不可用
食物相互作用
不可用

类别

药物类别
化学分类所提供的Classyfire
描述
这种化合物属于一类有机化合物,称为氨基酸及其衍生物。这些化合物在C5碳原子上含有一个羧酸和一个氨基。
王国
有机化合物
超类
有机酸及其衍生物
羧酸及其衍生物
子课
氨基酸、多肽和类似物
直接父
氨基酸及其衍生物
选择父母
γ氨基酸及其衍生物/单烷基磷酸/吡喃/Oxathianes/环氧乙烷/二羧酸及其衍生物/单糖/伯羧酸酰胺/氨基酸/羧酸酯
展示8个
1, 4-oxathiane/脂肪族杂多环化合物/烷基磷酸//氨基酸/羰基/甲酰胺组/羧酸/羧酸酯/氨基酸或衍生物
展示22个
分子框架
脂肪族杂多环化合物
外部描述符
不可用
受影响的生物
不可用

化学标识符

UNII
不可用
化学文摘号
87913-21-1
InChI关键
UVAAUIDYGIWLMB-HGNFPZBQSA-N
InChI
InChI = 1 s / C11H17N2O11PS c1-3(14) 22-5-4(12) 6(24 - 25日(19、20)21)10(9(16)17)2-26-11(18日8 (13)15)7 (5)23-10 / h4-7 18 H, 2, 12 H2、h3, (H2, 13日15)(H, 16、17)(H2, 19、20、21)/ t4 - 5 + 6 + 7 + 10 + 11 + / mo / s1
国际命名
(1 r, 4 r、5 r, r 6, 7, 8 r) 6 - (acetyloxy) 7-amino-4-carbamoyl-4-hydroxy-8 - (phosphonooxy) 9-oxa-3-thiabicyclo (3.3.1) nonane-1-carboxylic酸
微笑
[H] N ([H]) [C@H] 1 [C@@H] (OC (C) = O) (C@@) 2 ([H]) O (C@) (CS (C@@) 2 (O) C (= O) N ([H]) [H]) ([C@@H] 1 op (O) (O) = O) C = O (O)

参考文献

一般引用
  1. Plet JR, Porter MJ: tagetitoxin双环核的合成。化学公社(Camb)。2006 3月21日;(11):1197-9。Epub 2006 2月14日。[文章
  2. Vassylyev DG, Svetlov V, Vassylyeva MN, Perederina A, Igarashi N, Matsugaki N, Wakatsuki S, Artsimovitch I: tagetitoxin转录抑制的结构基础。分子生物学,2005 12月;12(12):1086-93。Epub 2005年11月6日。[文章
  3. Mathews DE, Durbin RD: tagetitoxin抑制来自大肠杆菌RNA聚合酶的机制方面。生物化学。1994 10月4日;33(39):11987-92。[文章
  4. Steinberg TH, Mathews DE, Durbin RD, Burgess RR: Tagetitoxin: RNA聚合酶III真核生物转录的新抑制剂。中国生物医学工程学报,1991,5(1):489 - 497。[文章
PubChem化合物
5327077
PubChem物质
46506068
ChemSpider
4484333
ZINC000012504512
PDBe配体
TGT
维基百科
Tagetitoxin
PDB项
2 be5

临床试验

临床试验Learn More" title="" id="clinical-trials-info" class="drug-info-popup" href="javascript:void(0);">
阶段 状态 目的 条件

药物经济学

制造商
不可用
外包商
不可用
剂型
不可用
价格
不可用
专利
不可用

属性

状态
固体
实验属性
不可用
预测性能
财产 价值
水溶度 37.5毫克/毫升 ALOGPS
logP -1.5 ALOGPS
logP -3.8 Chemaxon
日志 -1 ALOGPS
pKa(最强酸性) 0.85 Chemaxon
pKa(最强基础) 8.72 Chemaxon
生理上的电荷 -2 Chemaxon
氢受体计数 10 Chemaxon
氢供体数量 6 Chemaxon
极表面积 228.932 Chemaxon
可旋转键数 6 Chemaxon
折射性 80.58米3.·摩尔-1 Chemaxon
极化率 34.213. Chemaxon
环数 2 Chemaxon
生物利用度 0 Chemaxon
五原则 没有 Chemaxon
Ghose用过滤器 没有 Chemaxon
Veber法则 没有 Chemaxon
MDDR-like规则 没有 Chemaxon
ADMET预测特征
财产 价值 概率
人体肠道吸收 - 0.9526
血脑屏障 - 0.8728
Caco-2渗透 - 0.678
22基板 Non-substrate 0.5244
p -糖蛋白抑制剂I Non-inhibitor 0.755
p -糖蛋白抑制剂II Non-inhibitor 1.0
肾有机阳离子转运体 Non-inhibitor 0.9637
CYP450 2C9底物 Non-substrate 0.6653
CYP450 2D6衬底 Non-substrate 0.8187
CYP450 3A4衬底 Non-substrate 0.5
CYP450 1A2底物 Non-inhibitor 0.7787
CYP450 2C9抑制剂 Non-inhibitor 0.8173
CYP450 2D6抑制剂 Non-inhibitor 0.9095
CYP450 2C19抑制剂 Non-inhibitor 0.793
CYP450 3A4抑制剂 Non-inhibitor 0.892
CYP450抑制性乱交 低CYP抑制性乱交 0.9468
艾姆斯测试 非AMES毒性 0.5863
致癌性 Non-carcinogens 0.9072
生物降解 未准备好生物可降解 0.9783
大鼠急性毒性 2.5607 LD50, mol/kg 不适用
hERG抑制(预测因子I) 弱的抑制剂 0.9967
hERG抑制(预测因子II) Non-inhibitor 0.8383
ADMET数据预测使用admetSAR,一个用于评估化学ADMET性能的免费工具。(23092397

光谱

质谱仪(NIST)
不可用
光谱
光谱 光谱类型 飞溅的关键
预测GC-MS谱 预测气相 不可用
预测MS/MS谱- 10V,阳性(标注) 预测质/女士 不可用
预测质谱- 20V,阳性(带注释) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 40V,阳性(标注) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 10V,阴性(标注) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 20V,阴性(标注) 预测质/女士 不可用
预测MS/MS谱- 40V,阴性(标注) 预测质/女士 不可用

目标

建立、预测和验证机器学习模型
使用我们的结构化和基于证据的数据集开启新
洞察和加速药物研究。必威国际app
了解更多
使用我们的结构化和循证数据集来解锁新的见解并加速药物研究。必威国际app
了解更多
种类
蛋白质
生物
嗜热热杆菌(HB8 / ATCC 27634 / DSM 579菌株)
药理作用
未知的
通用函数
核糖核苷绑定
特定的功能
DNA依赖的RNA聚合酶以四种三磷酸核糖核苷为底物,催化DNA转录成RNA。
基因名字
rpoB
Uniprot ID
Q8RQE9
Uniprot名字
dna定向RNA聚合酶亚基β
分子量
125263.41哒
参考文献
  1. Vassylyev DG, Svetlov V, Vassylyeva MN, Perederina A, Igarashi N, Matsugaki N, Wakatsuki S, Artsimovitch I: tagetitoxin转录抑制的结构基础。分子生物学,2005 12月;12(12):1086-93。Epub 2005年11月6日。[文章
种类
蛋白质
生物
嗜热热杆菌(HB8 / ATCC 27634 / DSM 579菌株)
药理作用
未知的
通用函数
dna定向rna聚合酶活性
特定的功能
DNA依赖的RNA聚合酶以四种三磷酸核糖核苷为底物,催化DNA转录成RNA。
基因名字
rpoC
Uniprot ID
Q8RQE8
Uniprot名字
dna定向RNA聚合酶亚基β '
分子量
170755.075哒
参考文献
  1. Vassylyev DG, Svetlov V, Vassylyeva MN, Perederina A, Igarashi N, Matsugaki N, Wakatsuki S, Artsimovitch I: tagetitoxin转录抑制的结构基础。分子生物学,2005 12月;12(12):1086-93。Epub 2005年11月6日。[文章

创建于2007年9月11日17:49 /更新于2020年6月12日16:52