Meso-diaminopimelate D-dehydrogenase

细节

的名字
Meso-diaminopimelate D-dehydrogenase
同义词
  • 1.4.1.16
  • DAPDH
基因名字
ddh
生物
棒状杆菌属glutamicum(写明ATCC 13032株/ DSM JCM 1318 /液化沼气3730 20300 / / NCIMB 10025)
氨基酸序列
>拼箱| BSEQ0011128 | Meso-diaminopimelate D-dehydrogenase MTNIRVAIVGYGNLGRSVEKLIAKQPDMDLVGIFSRRATLDTKTPVFDVADVDKHADDVD VLFLCMGSATDIPEQAPKFAQFACTVDTYDNHRDIPRHRQVMNEAATAAGNVALVSTGWD PGMFSINRVYAAAVLAEHQQHTFWGPGLSQGHSDALRRIPGVQKAVQYTLPSEDALEKAR RGEAGDLTGKQTHKRQCFVVADAADHERIENDIRTMPDYFVGYEVEVNFIDEATFDSEHT GMPHGGHVITTGDTGGFNHTVEYILKLDRNPDFTASSQIAFGRAAHRMKQQGQSGAFTVL EVAPYLLSPENLDDLIARDV
数量的残留物
320年
分子量
35199.135
理论π
5.19
去分类
功能
diaminopimelate脱氢酶活性
流程
diaminopimelate生物合成的过程/通过diaminopimelate赖氨酸生物合成的过程
通用函数
Diaminopimelate脱氢酶活性
特定的功能
催化可逆NADPH-dependent L-2-amino-6-oxopimelate,还原胺化的非循环形式L-tetrahydrodipicolinate,生成内消旋化合物,D, l2, 6-diaminopimelate。可能在赖氨酸生物合成过程中发挥作用。6-diaminopimelate meso-2高底物特异性的表现,因为L, l2, 6-diaminopimelate, D, d2, 6-diaminopimelate, L-glutamate,丙氨酸,L-leucine, L-valine, L-aspartate,苏氨酸,L-homoserine, L-methionine,赖氨酸,L-serine, L-phenylalanine,酪氨酸、色氨酸,L-ornithine,组氨酸、精氨酸、D-glutamate, D-alanine不是底物的氧化脱氨基作用的反应。可以使用NAD(+)只差自活动中观察到的NAD(+)约为3%,与辅酶ii (+)。
域包含了函数
跨膜区
不可用
细胞的位置
不可用
基因序列
>拼箱| BSEQ0011129 | Meso-diaminopimelate D-dehydrogenase (ddh) ATGACCAACATCCGCGTAGCTATCGTGGGCTACGGAAACCTGGGACGCAGCGTCGAAAAG CTTATTGCCAAGCAGCCCGACATGGACCTTGTAGGAATCTTCTCGCGCCGGGCCACCCTC GACACAAAGACGCCAGTCTTTGATGTCGCCGACGTGGACAAGCACGCCGACGACGTGGAC GTGCTGTTCCTGTGCATGGGCTCCGCCACCGACATCCCTGAGCAGGCACCAAAGTTCGCG CAGTTCGCCTGCACCGTAGACACCTACGACAACCACCGCGACATCCCACGCCACCGCCAG GTCATGAACGAAGCCGCCACCGCAGCCGGCAACGTTGCACTGGTCTCTACCGGCTGGGAT CCAGGAATGTTCTCCATCAACCGCGTCTACGCAGCGGCAGTCTTAGCCGAGCACCAGCAG CACACCTTCTGGGGCCCAGGTTTGTCACAGGGCCACTCCGATGCTTTGCGACGCATCCCT GGCGTTCAAAAGGCAGTCCAGTACACCCTCCCATCCGAAGACGCCCTGGAAAAGGCCCGC CGCGGCGAAGCCGGCGACCTTACCGGAAAGCAAACCCACAAGCGCCAATGCTTCGTGGTT GCCGACGCGGCCGATCACGAGCGCATCGAAAACGACATCCGCACCATGCCTGATTACTTC GTTGGCTACGAAGTCGAAGTCAACTTCATCGACGAAGCAACCTTCGACTCCGAGCACACC GGCATGCCACACGGTGGCCACGTGATTACCACCGGCGACACCGGTGGCTTCAACCACACC GTGGAATACATCCTCAAGCTGGACCGAAACCCAGATTTCACCGCTTCCTCACAGATCGCT TTCGGTCGCGCAGCTCACCGCATGAAGCAGCAGGGCCAAAGCGGAGCTTTCACCGTCCTC GAAGTTGCTCCATACCTGCTCTCCCCAGAGAACTTGGACGATCTGATCGCACGCGACGTC TAA
染色体的位置
不可用
轨迹
不可用
外部标识符
资源 链接
UniProtKB ID P04964
UniProtKB条目名称 DAPDH_CORGL
基因库蛋白质ID 40493年
基因库基因身份证 Y00151
一般引用
  1. Ishino S Mizukami T,山口K,清水正孝R,荒木凯西:核苷酸序列的meso-diaminopimelate D-dehydrogenase基因棒状杆菌glutamicum。核酸研究》1987年5月11日,15 (9):3917。(文章]
  2. Ikeda M,中川年代:棒状杆菌glutamicum基因组:特性和对生物技术过程的影响。生物科技:Microbiol》。2003年8月,62 (2):99 - 109。2003年5月13日Epub。(文章]
  3. Kalinowski J,洗澡B, Bartels D、比肖夫N,堵塞M, Burkovski, Dusch N, Eggeling L, Eikmanns BJ, Gaigalat L, Goesmann,哈特曼M, Huthmacher K,克雷默R,左翼B, McHardy AC, Meyer F, Mockel B, Pfefferle W,普尔,雷伊哒,Ruckert C,鲁普O, Sahm H, Wendisch VF, Wiegrabe我潜水,黑豹完成棒状杆菌glutamicum写明ATCC 13032基因组序列及其对生产的影响L-aspartate-derived氨基酸和维生素。104年生物科技J》。2003年9月4日,(1 - 3):做些。(文章]
  4. Reddy SG, Scapin G,布兰查德JS: meso-diaminopimelate脱氢酶的表达,纯化,结晶棒状杆菌glutamicum。蛋白质。1996年8月,25 (4):514 - 6。(文章]
  5. Scapin G, Reddy SG,布兰查德JS: meso-diaminopimelic酸脱氢酶的三维结构棒状杆菌glutamicum。生物化学。1996年10月22日,35 (42):13540 - 51。(文章]
  6. 高Scapin G, Cirilli M, Reddy SG, Y, Vederas JC,布兰查德JS:底物和抑制剂结合位点在棒状杆菌glutamicum diaminopimelate脱氢酶。生物化学。1998年3月10日,37 (10):3278 - 85。(文章]
  7. Cirilli M, Scapin G,萨瑟兰,Vederas JC,布兰查德JS:三元复杂的三维结构的棒状杆菌glutamicum diaminopimelate dehydrogenase-NADPH-L-2-amino-6-methylene-pimelate。蛋白质科学。2000年10月,9 (10):2034 - 7。(文章]

药物的关系

药物的关系
DrugBank ID 的名字 药物组 药理作用? 行动 细节
DB02892 L-2-Amino-6-Methylene-Pimelic酸 实验 未知的 细节
DB03590 2,6-Diaminopimelic酸 实验 未知的 细节