cAMP-activated全球转录监管机构CRP

细节

的名字
cAMP-activated全球转录监管机构CRP
同义词
  • 营受体蛋白质
  • 营管理蛋白质
  • 帽
  • 分解代谢物激活蛋白
  • 分解代谢物基因激活
  • c反应蛋白
  • csm
基因名字
c反应蛋白
生物
大肠杆菌(应变K12)
氨基酸序列
>拼箱| BSEQ0011452 | cAMP-activated全球转录监管机构CRP MVLGKPQTDPTLEWFLSHCHIHKYPSKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGKEM ILSYLNQGDFIGELGLFEEGQERSAWVRAKTACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQ MARRLQVTSEKVGNLAFLDVTGRIAQTLLNLAKQPDAMTHPDGMQIKITRQEIGQIVGCS RETVGRILKMLEDQNLISAHGKTIVVYGTR
数量的残留物
210年
分子量
23640.275
理论π
8.46
去分类
功能
营绑定/DNA结合/转录因子的活动,sequence-specific DNA结合
流程
碳的降解物阻遏转录/负调节转录,dna模板/积极的调控转录,dna模板/转录,dna模板
组件
胞质
通用函数
转录因子的活动,sequence-specific dna结合
特定的功能
一个全球转录监管机构。复合物与环腺苷酸(营),变构激活DNA结合(共识序列5 -AAATGTGATCTAGATCACATTT-3)直接调节转录约300,约200个基因操纵子和间接调节大约一半的基因的表达。有3类c反应蛋白启动子;类我启动子有一个CRP-binding网站上游的RNA聚合酶(RNAP)绑定的网站,而在二类推动者单一CRP和RNAP-binding网站重叠,CRP与RNAP多个接触。第三类促进剂需要多个活化剂分子,包括至少一个c反应蛋白二聚体。它可以作为一个催化剂,阻遏,共激活剂或辅阻遏物。引发严重的弯曲DNA(大约87度),将接触RNAP上游启动子元素。作为负调节自己的合成以及腺苷酸环化酶(cyaA),生成营地。高水平的活性CRP是不利于增长(PubMed: 16260780)。中起着重要作用的碳降解物阻遏(CCR)。 CCR involves cAMP, adenylate cyclase (cyaA), CRP and the EIIA-Glc component of the PTS (crr). In the presence of glucose EIIA-Glc is dephosphorylated, and does not activate adenylate cyclase, leading to reduced cAMP and thus decreased CRP activity. Also plays a role in many other processes (see PubMed:22573269).
域包含了函数
跨膜区
不可用
细胞的位置
胞质
基因序列
>拼箱| BSEQ0011453 | cAMP-activated全球转录监管机构c反应蛋白(CRP) ATGGTGCTTGGCAAACCGCAAACAGACCCGACTCTCGAATGGTTCTTGTCTCATTGCCAC ATTCATAAGTACCCATCCAAGAGCAAGCTTATTCACCAGGGTGAAAAAGCGGAAACGCTG TACTACATCGTTAAAGGCTCTGTGGCAGTGCTGATCAAAGACGAAGAGGGTAAAGAAATG ATCCTCTCCTATCTGAATCAGGGTGATTTTATTGGCGAACTGGGCCTGTTTGAAGAGGGC CAGGAACGTAGCGCATGGGTACGTGCGAAAACCGCCTGTGAAGTGGCTGAAATTTCGTAC AAAAAATTTCGCCAATTGATTCAGGTAAACCCGGACATTCTGATGCGTTTGTCTGCACAG ATGGCGCGTCGTCTGCAAGTCACTTCAGAGAAAGTGGGCAACCTGGCGTTCCTCGACGTG ACGGGCCGCATTGCACAGACTCTGCTGAATCTGGCAAAACAACCAGACGCTATGACTCAC CCGGACGGTATGCAAATCAAAATTACCCGTCAGGAAATTGGTCAGATTGTCGGCTGTTCT CGTGAAACCGTGGGACGCATTCTGAAGATGCTGGAAGATCAGAACCTGATCTCCGCACAC GGTAAAACCATCGTCGTTTACGGCACTCGTTAA
染色体的位置
不可用
轨迹
不可用
外部标识符
资源 链接
UniProtKB ID P0ACJ8
UniProtKB条目名称 CRP_ECOLI
基因库蛋白质ID 145594年
基因库基因身份证 J01598
一般引用
  1. Aiba H,藤本年代,Ozaki N:分子克隆和基因的核苷酸序列大肠杆菌阵营受体蛋白质。核酸研究》1982年2月25日,10 (4):1345 - 61。(文章]
  2. Cossart P, Gicquel-Sanzey B: c反应蛋白基因的克隆和序列大肠杆菌K 12。核酸研究》1982年2月25日,10 (4):1363 - 78。(文章]
  3. 布拉特纳FR,冷藏室G 3日,布洛赫CA,佩纳NT, Burland V,莱利M, Collado-Vides J, Glasner JD, CK,梅休GF,格雷戈尔J,戴维斯NW,柯克帕特里克哈,Goeden妈,玫瑰DJ,茂B,邵Y:大肠杆菌k - 12的完整基因组序列。科学。1997年9月5日,277 (5331):1453 - 62。(文章]
  4. Hayashi K, Morooka N,山本Y, Fujita K, Isono K,崔年代,大坪E,巴巴T,万纳提单,Mori H, Horiuchi T:高度准确的大肠杆菌基因组序列的K - 12株MG1655 W3110。摩尔系统杂志。2006;2:2006.0007。Epub 2006年2月21日。(文章]
  5. 大冢Y,四郎M, Iwamoto Yonesaki T:核糖核酸酶的作用RnlA LS活动从大肠杆菌。麝猫的基因系统。2007年8月,82 (4):291 - 9。(文章]
  6. Sabourin D, Beckwith J:大肠杆菌crp基因的删除。J Bacteriol。1975年4月,122 (1):338 - 40。(文章]
  7. Aiba H:大肠杆菌的自身调节crp基因:c反应蛋白是一种转录抑制因子的基因。细胞。1983年1月,32 (1):141 - 9。(文章]
  8. Aiba H:大肠杆菌腺苷酸环化酶基因的转录负受cAMP-cAMP受体蛋白。J生物化学杂志。1985年3月10,260 (5):3063 - 70。(文章]
  9. 绅士我,Gartner的年代,Gronenborn, Sandulache R,丁香通用:基因定点突变体的受体蛋白质- DNA结合的五个突变的蛋白质。蛋白质Eng。1987年6月,1 (3):201 - 3。(文章]
  10. Gartner Gronenborn, Sandulache R, S,丁香通用:突变环腺苷酸环腺苷酸受体蛋白的结合位点,大肠杆菌。j . 1988 8月1;253 (3):801 - 7。(文章]
  11. Pinkney M, Hoggett詹:绑定环腺苷酸受体蛋白的RNA聚合酶的大肠杆菌。j . 1988 3月15日,250 (3):897 - 902。(文章]
  12. Igarashi K, Ishihama答:一式两份的功能性映射的大肠杆菌RNA聚合酶α亚基:c端地区参与cAMP-CRP转录激活。细胞。1991年6月14日,65(6):1015 - 22所示。(文章]
  13. 负责人,Aiba H:一个新的大肠杆菌crp基因的转录控制方面:积极的自动调整。摩尔Microbiol。1992年9月,6 (17):2489 - 97。(文章]
  14. Ryu年代,金正日J, Adhya年代,汽车销售:关键作用的氨基酸位置138营受体蛋白变构铰链的重新定位。《美国国家科学院刊S a . 1993年1月1,90 (1):75 - 9。(文章]
  15. 张周Y, X, Ebright RH:识别激活区域的分解代谢物基因激活蛋白(CAP):隔离和表征帽专门有缺陷的突变体的转录激活。《美国国家科学院刊a . 1993 7月1;90 (13):6081 - 5。(文章]
  16. 董妞妞W,周Y, Q, Ebright YW, Ebright RH:表征的激活区域的大肠杆菌分解代谢物基因激活蛋白(帽)。饱和度和alanine-scanning诱变。J杂志。1994年11月4日,243 (4):595 - 602。(文章]
  17. 妞妞W,金正日Y,τG, Heyduk T, Ebright RH:二类帽依赖启动子转录激活:两个帽和RNA聚合酶之间的相互作用。细胞。1996年12月13日,87 (6):1123 - 34。(文章]
  18. 奥尔森VanBogelen RA,爱博夏尔KZ, Moldover B,呃,Neidhardt FC:大肠杆菌蛋白质组分析使用gene-protein数据库。电泳。1997年8月18日(8):1243 - 51。(文章]
  19. Rhodius VA,巴斯比SJ:大肠杆菌的转录激活环腺苷酸受体蛋白:区域内激活因素3。2000 J杂志。299年6月2;(2):295 - 310。(文章]
  20. Rhodius VA,巴斯比SJ:之间的交互激活区域3的大肠杆菌环腺苷酸受体蛋白和RNA聚合酶的地区4σ(70)亚基:抑制遗传学中的应用。J杂志。2000年6月2,299 (2):311 - 24。(文章]
  21. 李余年代,JC:残留的角色138 interdomain铰链地区传输变构信号受体蛋白质在大肠杆菌DNA结合营地。生物化学。2004年4月27日,43 (16):4662 - 9。(文章]
  22. 郑D, Constantinidou C, Hobman杰,Minchin SD:识别C反应蛋白的调节子使用体外和体内转录剖析。核酸研究》2004年11月1日,32 (19):5874 - 93。打印2004。(文章]
  23. 格兰杰直流,赫德D,哈里森M,自J,巴斯比SJ:大肠杆菌的分布的研究cAMP-receptor蛋白质和RNA聚合酶在大肠杆菌染色体。《美国国家科学院刊S a . 2005年12月6日,102 (49):17693 - 8。Epub 2005年11月21日。(文章]
  24. 只要H, Kerby RL,康拉德M,罗伯茨医生:高度持续活跃的突变体的研究显示如何激活受体蛋白质号营。J生物化学杂志。2006年1月13日,281(2):1119 - 27所示。Epub 2005年10月31日。(文章]
  25. Iwamoto, Lemire S Yonesaki T:由核糖核酸酶转录后控制Crp-cAMP LS在大肠杆菌。摩尔Microbiol。2008年12月,70 (6):1570 - 8。doi: 10.1111 / j.1365-2958.2008.06504.x。Epub 2008年10月23日。(文章]
  26. 张J,出现R,裴J,谭X,金正日年代,朱H,刘CF, Grishin NV,赵Y:赖氨酸乙酰化是一个非常丰富和大肠杆菌进化保存修改。摩尔细胞蛋白质组学。2009年2月,8(2):215 - 25所示。doi: 10.1074 / mcp.M800187-MCP200。Epub 2008年8月23日。(文章]
  27. 科尔布,巴斯比年代,Buc H,停车库建设年代,Adhya S:转录调节营及其受体蛋白。学生物化学为基础。1993;62:749 - 95。(文章]
  28. 巴斯比年代,Ebright RH:转录激活分解代谢物激活蛋白(帽)。J杂志。1999年10月22日,293 (2):199 - 213。(文章]
  29. 获得商品,李y,李SH,李奉:结构概述的变构激活环腺苷酸受体蛋白。Biochim Biophys学报。2009年9月,1794 (9):1299 - 308。doi: 10.1016 / j.bbapap.2009.04.015。2009年5月9日Epub。(文章]
  30. 塞万提斯,埃斯卡兰特萨利纳斯,戈塞特G,玻利瓦尔F:大肠杆菌的当前知识phosphoenolpyruvate-carbohydrate磷酸转移酶系统:监管和对经济增长的影响的特点和产品的形成。生物科技:Microbiol》。2012年6月,94 (6):1483 - 94。doi: 10.1007 / s00253 - 012 - 4101 - 5。2012年5月11日Epub。(文章]
  31. 麦凯DB,韦伯,施泰茨助教:结构在2.9 a分辨率分解代谢物基因激活蛋白。的氨基酸序列与环腺苷酸和交互。J临床生物化学。1982年8月25日,257 (16):9518 - 24。(文章]
  32. 韦伯,施泰茨助教:复杂的结构分解代谢物基因激活蛋白和环腺苷酸精制2.5决议。J杂志。1987年11月20日,198(2):311 - 26所示。(文章]
  33. 舒尔茨SC,盾牌GC,施泰茨助教:CAP-DNA复杂的晶体结构:DNA弯曲90度。科学。1991年8月30日,253 (5023):1001 - 7。(文章]
  34. 帕金森G,威尔逊C, Gunasekera Ebright YW, Ebright RH,伯曼恩:CAP-DNA复杂结构为2.5埃分辨率:一个完整的照片protein-DNA接口。J杂志。1996年7月19日,260 (3):395 - 408。(文章]
  35. Passner JM,施泰茨助教:CAP-DNA复杂的结构有两个阵营分子绑定到每个单体。《美国国家科学院刊a . 1997 4月1;94 (7):2843 - 7。(文章]
  36. Passner JM,舒尔茨SC施泰茨助教:建模cAMP-induced变构过渡使用CAP-cAMP分辨率2.1的晶体结构。J杂志。2000年12月15日,304 (5):847 - 59。(文章]
  37. 杨Benoff B, H,劳森CL,帕金森G,刘J,布拉特E, Ebright YW,伯曼嗯,Ebright RH:转录激活结构基础:CAP-alpha CTD-DNA复杂。科学。2002年8月30日,297 (5586):1562 - 6。(文章]
  38. Popovych N, Tzeng SR, Tonelli M, Ebright RH, Kalodimos CG:结构性基础cAMP-mediated变构控制分解代谢物激活蛋白。《美国国家科学院刊S a . 2009年4月28日;106 (17):6927 - 32。doi: 10.1073 / pnas.0900595106。Epub 2009年4月9日。(文章]
  39. Sharma H, Yu年代,香港J,王J,施泰茨助教:apo-CAP结构表明,大型构象变化对DNA结合是必要的。《美国国家科学院刊S a . 2009年9月29日,106 (39):16604 - 9。doi: 10.1073 / pnas.0908380106。Epub 2009年9月16日。(文章]
  40. 哈德逊BP奎斯佩J, Lara-Gonzalez年代,金正日Y,伯曼嗯,阿诺德E, Ebright RH,劳森CL:三维电磁结构的完整activator-dependent转录起始复合物。《美国国家科学院刊S a . 2009年11月24日,106 (47):19830 - 5。doi: 10.1073 / pnas.0908782106。Epub 2009 11月10。(文章]
  41. Tzeng SR Kalodimos CG:变构抑制通过抑制瞬态构象状态。Nat化学杂志。2013;9 (7):462 - 5。doi: 10.1038 / nchembio.1250。2013年5月5日Epub。(文章]

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