d -丙氨酰- d -丙氨酸羧肽酶DacA

细节

的名字

d -丙氨酰- d -丙氨酸羧肽酶DacA

同义词

• 3.4.16.4
• Beta-lactamase
• DD-carboxypeptidase
• PBP-5
• 青霉素结合蛋白5
• pfv

基因名字

dacA

生物

大肠杆菌(菌株K12)

氨基酸序列

d -丙氨酸- d -丙氨酸羧肽酶DacA MNTIFSARIMKRLALTTALCTAFISAAHADDLNIKTMIPGVPQIDAESYILIDYNSGKVL AEQNADVRRDPASLTKMMTSYVIGQAMKAGKFKETDLVTIGNDAWATGNPVFKGSSLMFL KPGMQVPVSQLIRGINLQSGNDACVAMADFAAGSQDAFVGLMNSYVNALGLKNTHFQTVH gldadgqyssardmaligqalirdvpneysiykekeftfngirqlnrnlwdnslnvdg iktghtdkagalklltwgfrffetvnplkv gkefasepvwwfgdsdraslgvddvyltiprgrmkdlkasyvlnsselhaplqknktieqrplvvlqeipegnffgkiidyiklmfhhwfg

残差数

403

分子量

44443.62

理论π

8.58

去分类

功能

beta-lactamase活动/羧肽酶的活动/肽链内切酶活性/青霉素绑定/丝氨酸型D-Ala-D-Ala羧肽酶活性

流程

细胞壁大分子代谢过程/细胞壁组织/肽聚糖生物合成工艺/肽聚糖代谢过程/细胞形状调控

组件

质膜的组成部分

通用函数

丝氨酸型d-ala-d-ala羧肽酶活性

特定的功能

从糖肽细胞壁前体中去除c端d -丙酰残基。

Pfam域函数

• PBP5_C (PF07943）
• Peptidase_S11 (PF00768）

跨膜区

不可用

细胞的位置

细胞内膜

基因序列

>拼箱| BSEQ0020585 | D-alanyl-D-alanine羧肽酶DacA (DacA) ATGAATACCATTTTTTCCGCTCGTATCATGAAGCGCCTGGCGCTCACCACGGCTCTTTGC ACAGCCTTTATCTCTGCTGCACATGCCGATGACCTGAATATCAAAACTATGATCCCGGGT GTACCGCAGATCGATGCGGAGTCCTACATCCTGATTGACTATAACTCCGGCAAAGTGCTC GCCGAACAGAACGCAGATGTCCGCCGCGATCCTGCCAGCCTGACCAAAATGATGACCAGT TACGTTATCGGCCAGGCAATGAAAGCCGGTAAATTTAAAGAAACTGATTTAGTCACTATC GGCAACGACGCATGGGCCACCGGTAACCCGGTGTTTAAAGGTTCTTCGCTGATGTTCCTC AAACCGGGCATGCAGGTTCCGGTTTCTCAGCTGATCCGCGGTATTAACCTGCAATCGGGTAACGATGCTTGTGTCGCCATGGCCGATTTTGCCGCTGGTAGCCAGGACGCTTTTGTTGGC TTGATGAACAGCTACGTTAACGCACTGGGCCTGAAAAATACCCACTTCCAGACGGTACAT GGTCTGGATGCTGATGGTCAGTACAGCTCCGCGCGAGATATGGCGCTGATCGGCCAGGCA TTGATCCGTGACGTACCGAATGAATACTCGATCTATAAAGAAAAAGAATTTACGTTTAAC GGTATTCGCCAGCTGAACCGTAACGGCCTGTTATGGGATAACAGCCTGAATGTCGACGGC ATCAAAACCGGACACACTGACAAAGCAGGTTACAACCTTGTTGCTTCTGCGACTGAAGGC CAGATGCGCTTGATTTCTGCGGTAATGGGCGGACGTACTTTTAAAGGCCGTGAAGCCGAA AGTAAAAAACTGCTAACCTGGGGCTTCCGTTTCTTTGAAACCGTTAACCCACTGAAAGTAggtaaagagttcgccttctgaaccggttttggttttggggttttggcgcttcgttagagagacgtgtacctgaccattccgcgtcggaaagagagc tatgtgctgaacagcagtgaacagcagtgagaaaaagaatcaggtctcggacacttccagcttgatgatggcaaaacgatcgagcagcccgcgttttttgcaagagaa atcccggagaggacttttgtattcggcaaaatcattattattttttttttttttaa

染色体的位置

不可用

轨迹

不可用

外部标识符

资源	链接
UniProtKB ID	P0AEB2
UniProtKB表项名称	DACA_ECOLI
基因ID	X06479

一般引用

1. brome - smith JK, Ioannidis I, Edelman A, Spratt BG:大肠杆菌青霉素结合蛋白5和6基因的核苷酸序列。核酸决议1988年2月25日;16(4):1617。［文章］
2. 大岛T、Aiba H、Baba T、Fujita K、Hayashi K、Honjo A、Ikemoto K、Inada T、Itoh T、Kajihara M、Kanai K、Kashimoto K、Kimura S、Kitagawa M、Makino K、Masuda S、Miki T、Mizobuchi K、Mori H、Motomura K、Nakamura Y、Nashimoto H、Nishio Y、Saito N、Horiuchi T等:连锁图上12.7-28.0 min区域对应的大肠杆菌K-12基因组718 kb DNA序列。DNA res 1996 Jun 30;3(3):137-55。［文章］
3. Blattner FR, Plunkett G 3rd, Bloch CA, Perna NT, Burland V, Riley M, Collado-Vides J, Glasner JD, Rode CK, Mayhew GF, Gregor J, Davis NW, Kirkpatrick HA, Goeden MA, Rose DJ, Mau B, Shao Y:大肠杆菌K-12全基因组序列。科学，1997年9月5日;277(5331):1453-62。［文章］
4. Hayashi K, Morooka N, Yamamoto Y, Fujita K, Isono K, Choi S, Ohtsubo E, Baba T, Wanner BL, Mori H, Horiuchi T:大肠杆菌K-12菌株MG1655和W3110的高精度基因组序列。生物化学学报。2006;2:2006.0007。Epub 2006年2月21日。［文章］
5. brome - smith J, Spratt BG:阻断大肠杆菌青霉素结合蛋白5酶机制中去酰基化步骤的氨基酸替代。FEBS Lett 1984年1月9日;165(2):185-9。［文章］
6. Takase I, Ishino F, Wachi M, Kamata H, Doi M, Asoh S, Matsuzawa H, Ohta T, Matsuhashi M:大肠杆菌染色体leuS-dacA区两种脂蛋白的编码基因。细菌学杂志，1987 12月;169(12):5692-9。［文章］
7. 韦克曼，王晓明，王晓明，等。大肠杆菌青霉素结合蛋白5与A类β -内酰胺酶的氨基酸序列同源性研究。FEBS Lett 1982年3月22日;139(2):159-63。［文章］
8. Malhotra KT, Nicholas RA:用精氨酸取代大肠杆菌青霉素结合蛋白5中的赖氨酸213，可在不影响青霉素结合的情况下消除d -丙氨酸羧基肽酶活性。中国生物化学杂志。1992 6月5日;267(16):11386-91。［文章］
9. van der Linden MP, de Haan L, Keck W:用c端截断法分析大肠杆菌青霉素结合蛋白5的结构域组织。生物化学杂志1993年1月15日;289 (Pt 2):593-8。［文章］
10. VanBogelen RA, Abshire KZ, Moldover B, Olson ER, Neidhardt FC:基于基因蛋白数据库的大肠杆菌蛋白质组分析。电泳。1997 Aug;18(8):1243-51。［文章］
11. Davies C, White SW, Nicholas RA:青霉素结合蛋白5脱酰基缺陷突变体在2.3-A分辨率下的晶体结构。中国生物化学杂志，2001 1月5日;27(1):616-23。［文章］
12. Nicholas RA, Krings S, Tomberg J, Nicola G, Davies C:大肠杆菌野生型青霉素结合蛋白5的晶体结构:酰基-酶复合物脱酰基化的意义。中国生物化学杂志，2003年12月26日;Epub 2003年10月10日［文章］
13. Nicola G, Peddi S, Stefanova M, Nicholas RA, Gutheil WG, Davies C:大肠杆菌青霉素结合蛋白5与三肽硼酸抑制剂结合的晶体结构:Ser-110在脱酰基化中的作用。生物化学。2005 Jun 14;44(23):8207-17。［文章］

药物的关系

药物的关系

DrugBank ID	的名字	药物组	药理作用?	行动	细节
DB04647	BOC-GAMMA-D-GLU-L-LYS -D-BOROALA(卡马西平)	实验	未知的		细节
DB01329	头孢哌酮	批准,临床实验	是的	抑制剂	细节
DB01331	头孢西丁	批准	是的	抑制剂	细节
DB00274	头孢美唑	批准,临床实验	是的	抑制剂	细节
DB01147	邻氯青霉素	批准，调查，批准	是的	抑制剂	细节
DB00578	羧苄青霉素	批准,临床实验	是的	抑制剂	细节
DB09319	卡茚西林	批准,临床实验	是的	抑制剂	细节
DB09050	Ceftolozane	批准,临床实验	未知的		细节
DB01602	巴卡西林	批准,临床实验	是的	抑制剂	细节
DB01000	Cyclacillin	批准	是的	抑制剂	细节