DNA拓扑异构酶1

细节

的名字
DNA拓扑异构酶1
同义词
  • 5.99.1.2
  • DNA拓扑异构酶我
基因名字
TOP1
生物
人类
氨基酸序列
>拼箱| BSEQ0001933 | DNA拓扑异构酶1 MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKEKDREKSKHSNSEHKDSEKK HKEKEKTKHKDGSSEKHKDKHKDRDKEKRKEEKVRASGDAKIKKEKENGFSSPPQIKDEP EDDGYFVPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPKKIKTEDTKKEKKRKLEEEEDGKLKKPKNKD KDKKVPEPDNKKKKPKKEEEQKWKWWEEERYPEGIKWKFLEHKGPVFAPPYEPLPENVKF YYDGKVMKLSPKAEEVATFFAKMLDHEYTTKEIFRKNFFKDWRKEMTNEEKNIITNLSKC DFTQMSQYFKAQTEARKQMSKEEKLKIKEENEKLLKEYGFCIMDNHKERIANFKIEPPGL FRGRGNHPKMGMLKRRIMPEDIIINCSKDAKVPSPPPGHKWKEVRHDNKVTWLVSWTENIqgsikyimlnpssrikgekdwqkyetarrlkcvdkirnqyredwkskemkvrqravaly fidklalragnekeegetadtvgccslrvehinlhpeldgqeyvvefdflgkdsiryynk vpvekrvvfknlqlfmenkqpedlfdrlntgilnkhlqdlmegltakvfrtynasitlqq qlkeltapdenipakilsynranravailcnhqrappktfeksmmnlqtkidakkeqlad arrdlksakadakvmkdaktkkvveskkkavqrleeqlmklevqatdreenkqialgtsk lnyldpritvawckkwgvpiekiynkqrekfawaimadedyef
数量的残留物
765
分子量
90725.19
理论π
9.95
去分类
功能
染色质绑定/核心启动子序列特异性DNA结合/DNA结合/DNA拓扑异构酶I型活性/DNA拓扑异构酶II型(atp水解)活性/保利(A) RNA绑定
流程
染色质重塑/染色体隔离/基因表达的昼夜节律调节/昼夜节律/DNA复制/DNA拓扑变化/胚胎卵裂/磷酸化/程序性细胞死亡/药物反应/病毒的过程
组件
细胞质mRNA处理体/核仁/核浆/核/perikaryon/复制叉保护复合体
通用函数
保利(a) rna绑定
特定的功能
通过短暂的分裂和重新连接DNA双链，释放DNA复制和转录过程中引入的超卷曲和扭转张力。通过双链DNA靶位点的酯交换作用引入单链断裂。脱落的磷酸二酯被酶的催化酪氨酸攻击，导致DNA-(3'-磷酸酪氨酸)-酶中间体的形成和5'- oh DNA链的排出。然后，游离的DNA链绕过未断裂的DNA链，从而去除DNA超线圈。最后，在宗教步骤中，DNA 5’-OH攻击共价中间体，驱逐活性位点酪氨酸，恢复DNA磷酸二酯骨架(通过相似度)。调节内皮细胞中组织因子(F3) pre-mRNA的选择性剪接。通过改变ARNTL/BMAL1启动子上ROR响应元件(ROREs)周围的染色质结构，参与核心昼夜节律时钟组件ARNTL/BMAL1的昼夜转录。
域包含了函数
跨膜区
不可用
细胞的位置
核
基因序列
>lcl|BSEQ0016271|DNA拓扑异构酶1 (TOP1)一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个，一个千载难挨，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇，百年不遇GATTTTACCCAGATGAGCCAGTATTTCAAAGCCCAGACGGAAGCTCGGAAACAGATGAGC AAGGAAGAGAAACTGAAAATCAAAGAGGAGAATGAAAAATTACTGAAAGAATATGGATTC TGTATTATGGATAACCACAAAGAGAGGATTGCTAACTTCAAGATAGAGCCTCCTGGACTT TTCCGTGGCCGCGGCAACCACCCCAAGATGGGCATGCTGAAGAGACGAATCATGCCCGAG GATATAATCATCAACTGTAGCAAAGATGCCAAGGTTCCTTCTCCTCCTCCAGGACATAAG TGGAAAGAAGTCCGGCATGATAACAAGGTTACTTGGCTGGTTTCCTGGACAGAGAACATC CAAGGTTCCATTAAATACATCATGCTTAACCCTAGTTCACGAATCAAGGGTGAGAAGGAC TGGCAGAAATACGAGACTGCTCGGCGGCTGAAAAAATGTGTGGACAAGATCCGGAACCAGTATCGAGAAGACTGGAAGTCCAAAGAGATGAAAGTCCGGCAGAGAGCTGTAGCCCTGTAC TTCATCGACAAGCTTGCTCTGAGAGCAGGCAATGAAAAGGAGGAAGGAGAAACAGCGGAC ACTGTGGGCTGCTGCTCACTTCGTGTGGAGCACATCAATCTACACCCAGAGTTGGATGGT CAGGAATATGTGGTAGAGTTTGACTTCCTCGGGAAGGACTCCATCAGATACTATAACAAG GTCCCTGTTGAGAAACGAGTTTTTAAGAACCTACAACTATTTATGGAGAACAAGCAGCCC GAGGATGATCTTTTTGATAGACTCAATACTGGTATTCTGAATAAGCATCTTCAGGATCTC ATGGAGGGCTTGACAGCCAAGGTATTCCGTACATACAATGCCTCCATCACGCTACAGCAG CAGCTAAAAGAACTGACAGCCCCGGATGAGAACATCCCAGCGAAGATCCTTTCTTATAACCGTGCCAATCGAGCTGTTGCAATTCTTTGTAACCATCAGAGGGCACCACCAAAAACTTTT GAGAAGTCTATGATGAACTTGCAAACTAAGATTGATGCCAAGAAGGAACAGCTAGCAGAT GCCCGGAGAGACCTGAAAAGTGCTAAGGCTGATGCCAAGGTCATGAAGGATGCAAAGACG AAGAAGGTAGTAGAGTCAAAGAAGAAGGCTGTTCAGAGACTGGAGGAACAGTTGATGAAG CTGGAAGTTCAAGCCACAGACCGAGAGGAAAATAAACAGATTGCCCTGGGAACCTCCAAA CTCAATTATCTGGACCCTAGGATCACAGTGGCTTGGTGCAAGAAGTGGGGTGTCCCAATT GAGAAGATTTACAACAAAACCCAGCGGGAGAAGTTTGCCTGGGCCATTGACATGGCTGAT GAAGACTATGAGTTTTAG
染色体的位置
20.
轨迹
20 q12-q13.1
外部标识符
资源 链接
UniProtKB ID P11387
UniProtKB条目名称 TOP1_HUMAN
基因库蛋白质ID 339806
基因库基因身份证 J03250
GenAtlas ID TOP1
HGNC ID HGNC: 11986
一般引用
  1. D'Arpa P, Machlin PS, Ratrie H 3rd, Rothfield NF, Cleveland DW, Earnshaw WC:人类DNA拓扑异构酶I的cDNA克隆:66.7 kda羧基端片段的催化活性。美国科学院学报1988年4月;85(8):2543-7。［文章］
  2. Kunze N, Yang GC, Dolberg M, Sundarp R, Knippers R, Richter A:人I型DNA拓扑异构酶基因结构。生物化学杂志。1991年5月25日;266(15):9610-6。［文章］
  3. Ota T,铃木Y, Nishikawa T,大月T, Sugiyama T,老大R,若松,Hayashi K,佐藤H, Nagai K,木村K, Makita H,关根身上M,大林M, Nishi T, Shibahara T,田中T, Ishii年代,山本J,齐藤K,卡瓦依Y, Isono Y,中村Y, Nagahari K,村上K, Yasuda T, Iwayanagi T, Wagatsuma M,治广,Sudo H, Hosoiri T, Kaku Y, Kodaira H,近藤H,同样是十六米,高桥M,神田K, T横井,Furuya T,规划E, Omura Y,安倍K, Kamihara K, Katsuta N, K,佐藤Tanikawa M,山崎M,Ninomiya K, Ishibashi T,山下式H, Murakawa K,藤森K, Tanai H, Kimata M,渡边M, Hiraoka年代,千叶Y,石田年代,小野Y, Takiguchi年代,渡边,Yosida M, Hotuta T, Kusano J, K Kanehori, Takahashi-Fujii, Hara H,没有试图推高日圆,野村Y, Togiya年代,Komai F, Hara R,竹内K、M, Imose N,武藏野K,较H,大岛渚,佐佐木N, Aotsuka年代,Yoshikawa Y, Matsunawa H, Ichihara T, Shiohata N,佐年代,守屋年代,Momiyama H, Satoh N, Takami年代,遗体Y,分别铃木O,中川年代,Senoh,沟口健二H,转到Y,清水F, Wakebe H, Hishigaki H,渡边T, Sugiyama, Takemoto M,川上B,山崎M,渡边K, Kumagai, Itakura年代,Fukuzumi Y, Y藤森,Komiyama M,田代H, Tanigami,藤原T,小野T,山田K,藤井裕久Y, Ozaki K, Hirao M, Ohmori Y,川端康成,Hikiji T, Kobatake N, Inagaki H, Ikema Y, Okamoto年代,Okitani R,川上T,野口年代,伊藤T, Shigeta K, Senba T, Matsumura K, Y,只是美津浓T,森永M,佐佐木M, Togashi T, Oyama M,要么H,渡边,小松T, Mizushima-Sugano J, Satoh T, Shirai Y, Takahashi Y, Nakagawa K, Okumura K, Nagase T, Nomura N，菊池H, Masuho Y, Yamashita R, Nakai K, Yada T, Nakamura Y, Ohara O, Isogai T, Sugano S: 21,243个人类全长cdna的完全测序和表征。Nat Genet。2004 Jan;36(1):40-5。Epub 2003 12月21日。［文章］
  4. Matthews LH, Ashurst Deloukas P J,伯顿J,吉尔伯特詹,琼斯M, Stavrides G,阿尔梅达JP,巴贝奇AK, Bagguley CL,贝利J,巴洛KF,贝茨KN,胡子LM,贝尔DM,比斯利OP,鸟CP,布莱奇,布里奇曼,棕色的AJ,巴克D, Burrill W,巴特勒美联社,梳刷C,卡特NP,查普曼JC,夹M, G克拉克,克拉克LN,克拉克SY, Clee厘米,克莱格,Cobley VE、科利尔再保险,康纳R,寇比NR,库尔森,阿尔GJ,亡灵R, Dhami P,邓恩M,艾灵顿AG)、弗兰克兰是的,弗雷泽,法国L,获得P,Grafham DV,格里菲斯C,格里菲斯MN, Gwilliam R,大厅再保险,哈蒙德年代,哈雷杰,希思PD,何年代,霍尔顿杰,豪顿PJ,臀部E,亨特AR,狩猎,Jekosch K,约翰逊厘米,约翰逊D,凯MP,金伯利,国王,骑士,Laird门将,软件的年代,Lehvaslaiho MH, Leversha M,劳埃德·C,劳埃德DM,洛弗尔JD,沼泽六世,马丁•SL McConnachie LJ, McLay K, McMurray AA,米尔恩年代,Mistry D,摩尔MJ, Mullikin JC, Nickerson T,奥利弗·K·帕克,Patel R,皮尔斯助教,派克AI·菲利莫尔这样说道BJ, Prathalingam SR,帕朗柏RW,拉姆齐H,大米厘米,罗斯太,斯科特•CE Sehra港元,Shownkeen R,西姆斯,Skuce CD,史密斯ML, C,索德伦德管家CA, Sulston我,斯万米,梧桐N,泰勒R,三通L,托马斯•DW索普,特蕾西,Tromans AC, Vaudin米,墙,沃利斯JM, Whitehead SL,惠塔克P, Willey DL,威廉姆斯L,威廉姆斯SA Wilming L,雷PW,哈伯德T,杜宾RM,宾利博士,贝克年代,罗杰斯J:人类染色体的DNA序列,比较分析20。自然。2001年12月20-27日;414(6866):865-71。［文章］
  5. 昆泽N, Klein M, Richter A, Knippers R:人类DNA拓扑异构酶I基因启动子的结构表征。生物化学学报。1990 12月12日;194(2):323-30。［文章］
  6. Fujimori A, Harker WG, Kohlhagen G, Hoki Y, Pommier Y:喜树碱耐人白血病细胞系CEM/C2拓扑异构酶I催化位点的突变。Cancer Res. 1995年3月15日;55(6):1339-46。［文章］
  7. Oddou P, Schmidt U, Knippers R, Richter A:中和哺乳动物DNA拓扑异构酶I活性的单克隆抗体。生物化学学报。1988 11月15日;177(3):523-9。［文章］
  8. 周斌，Bastow KF，程永春:人类DNA拓扑异构酶I基因3'区特征分析。Cancer Res. 1989 july 15;49(14):3922-7。［文章］
  9. Maul GG, Jimenez SA, Riggs E, Ziemnicka-Kotula D:系统性硬化症标记抗原DNA拓扑异构酶I:与逆转录病毒p30gag蛋白序列相似，提示系统性硬化症患者自身免疫的可能原因。美国国家科学学报1989年11月86(21):8492-6。［文章］
  10. Ahuja HG, Felix CA, Aplan PD:与治疗相关的骨髓增生异常综合征相关的t(11;20)(p15;q11)染色体易位导致NUP98-TOP1融合。血液。1999年11月1日;94(9):3258-61。［文章］
  11. Rallabhandi P, Hashimoto K, Mo YY, Beck WT, Moitra PK, D'Arpa P:拓扑异构酶I的苏睦化作用参与核仁和核质之间的分配以及喜树碱对其的响应从核仁中清除。生物化学。2002 10月18日;277(42):40020-6。Epub 2002年7月30日。［文章］
  12. Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M:信号网络中的全局、体内和位点特异性磷酸化动力学。细胞。2006年11月3日;127(3):635-48。［文章］
  13. Khopde S, Simmons DT:猿猴病毒40 DNA复制依赖于拓扑异构酶I和T抗原c端之间的相互作用。病毒学报。2008 Feb;82(3):1136-45。Epub 2007年11月14日。［文章］
  14. Dephoure N, Zhou C, Villen J, Beausoleil SA, Bakalarski CE, Elledge SJ, Gygi SP:有丝分裂磷酸化的定量图谱。美国科学院学报2008 8月5日;105(31):10762-7。doi: 10.1073 / pnas.0805139105。Epub 2008年7月31日。［文章］
  15. Gauci S, Helbig AO, Slijper M, Krijgsveld J, Heck AJ, Mohammed S: Lys-N和胰蛋白酶在基于scx的精细方法中覆盖了磷蛋白组的互补部分。肛门化学2009年6月1日;81(11):4493-501。doi: 10.1021 / ac9004309。［文章］
  16. Eisenreich A, Bogdanov VY, Zakrzewicz A, Pries A, Antoniak S, polller W, Schultheiss HP, Rauch U: cdca2样激酶和DNA拓扑异构酶I调节人内皮细胞组织因子的选择性剪接。中国保函2009年3月13日;104(5):589-99。doi: 10.1161 / CIRCRESAHA.108.183905。Epub 2009年1月22日。［文章］
  17. Choudhary C, Kumar C, Gnad F, Nielsen ML, Rehman M, Walther TC, Olsen JV, Mann M:赖氨酸乙酰化作用作用于蛋白质复合物并协同调节主要细胞功能。科学。2009年8月14日;325(5942):834-40。doi: 10.1126 / science.1175371。Epub 2009年7月16日。［文章］
  18. Olsen JV, Vermeulen M, Santamaria A, Kumar C, Miller ML, Jensen LJ, Gnad F, Cox J, Jensen TS, Nigg EA, Brunak S, Mann M:定量磷蛋白组学揭示有丝分裂过程中广泛的全磷酸化位点占据。科学信号。2010 1月12日;3(104):ra3。doi: 10.1126 / scisignal.2000475。［文章］
  19. Burkard TR, Planyavsky M, Kaupe I, Breitwieser FP, Burckstummer T, Bennett KL, Superti-Furga G, Colinge J:人类中心蛋白质组的初步表征。BMC系统生物学。2011 1月26日;5:17。doi: 10.1186 / 1752-0509-5-17。［文章］
  20. Rigbolt KT, Prokhorova TA, Akimov V, Henningsen J, Johansen PT, Kratchmarova I, Kassem M, Mann M, Olsen JV, Blagoev B:人类胚胎干细胞分化过程中蛋白质组和磷酸化蛋白质组的全系统时间表征。科学信号。2011年3月15日;4(164):rs3。doi: 10.1126 / scisignal.2001570。［文章］
  21. Onishi Y, Kawano Y:拓扑异构酶I的节律结合对Bmal1转录和昼夜周期的影响。核酸学报2012 10月40(19):9482-92。doi: 10.1093 / nar / gks779。Epub 2012年8月16日。［文章］
  22. Bandyopadhyay K, Li P, Gjerset RA: ck2介导的拓扑异构酶I以丝氨酸506为靶点，增强拓扑异构酶I- dna结合，增加细胞喜树碱敏感性。7。2012;(11):e50427。doi: 10.1371 / journal.pone.0050427。Epub 2012年11月21日。［文章］
  23. 边艳，宋超，程坤，董敏，王芳，黄娟，孙东，王磊，叶敏，邹浩:酶法辅助RP-RPLC深度分析人肝脏磷蛋白组。蛋白质组学杂志，2014年1月16日;96:253-62。doi: 10.1016 / j.jprot.2013.11.014。Epub 2013年11月22日［文章］
  24. Hendriks IA, D’souza RC, Yang B, Verlaan-de Vries M, Mann M, Vertegaal AC:以位点特异性的方式揭示全球sumo化信号网络。分子生物学杂志。2014 10月;21(10):927-36。doi: 10.1038 / nsmb.2890。Epub 2014年9月14日［文章］
  25. 雷定波，史德华，李文华，李文华，李文华，李文华。DNA共价和非共价复合物中人拓扑异构酶I的晶体结构。科学。1998年3月6日;279(5356):1504-13。［文章］
  26. 史德华，MR . Redinbo, Qiu X, Hol WG, Champoux JJ:人类拓扑异构酶机制的模型。科学通报，1998年3月6日;279(5356):1534-41。［文章］
  27. Redinbo MR, Champoux JJ, Hol WG:从人类拓扑异构酶I与DNA复合物的晶体结构对催化机制的新见解。生物化学。2000年6月13日;39(23):6832-40。［文章］
  28. 李晓燕，李晓燕，李晓燕，等。8-Oxoguanine重组人拓扑异构酶活性位点的研究进展。中国生物医学工程学报2002年9月17日;39(6):369 - 369。Epub 2002 9月3日。［文章］
  29. Staker BL, Hjerrild K, Feese MD, Behnke CA, Burgin AB Jr, Stewart L:喜树碱类似物致拓扑异构酶I中毒的机理。美国科学院学报2002年11月26日;99(24):15387-92。Epub 2002年11月8日。［文章］
  30. Chrencik JE, Burgin AB, Pommier Y, Stewart L, Redinbo MR:白血病药物1- β - d -arabinofuranosylcytosine (Ara-C)对共价人拓扑异构酶I-DNA复合物结构的影响。生物化学杂志。2003年4月4日;278(14):12461-6。Epub 2003年1月17日。［文章］
  31. 王晓燕，王晓燕，王晓燕。赖氨酸532在人拓扑异构酶催化机制中的作用。中国生物医学工程学报2004年1月23日;279(4):2984-92。Epub 2003 10月31日。［文章］
  32. Chrencik JE, Staker BL, Burgin AB, Pourquier P, Pommier Y, Stewart L, Redinbo MR:人拓扑异构酶I突变对喜树碱抗性的机制。中华分子生物学杂志2004 6月11日;339(4):773-84。［文章］
  33. Staker BL, Feese MD, Cushman M, Pommier Y, Zembower D, Stewart L, Burgin AB:与人拓扑异构酶I-DNA共价复合物结合的三类抗癌药物的结构。中华医学化学杂志2005年4月7日;48(7):2336-45。［文章］
  34. Ioanoviciu A, Antony S, Pommier Y, Staker BL, Stewart L, Cushman M:一系列去氨基异喹啉拓扑异构酶I毒药的合成和作用机理研究揭示了通过x射线晶体学分析确定的三元dna -酶-抑制剂络合物中具有翻转取向的抑制剂。中华医学化学杂志2005 7月28日;48(15):4803-14。［文章］
  35. Tamura H, Kohchi C, Yamada R, Ikeda T, Koiwai O, Patterson E, Keene JD, Okada K, Kjeldsen E, Nishikawa K，等:喜树碱耐人DNA拓扑异构酶I cDNA的分子克隆及突变位点的鉴定。核酸法案1991年1月11日;19(1):69-75。［文章］
  36. 久保田n、Kanzawa F、西尾K、武田Y、Ohmori T、藤原Y、寺岛Y、斋条N: CPT-11耐药肺癌细胞系拓扑异构酶I基因点突变的检测。生物化学生物物理学报。1992年10月30日;188(2):571-7。［文章］
  37. Sjoblom T、Jones S、Wood LD、Parsons DW、Lin J、Barber TD、Mandelker D、Leary RJ、Ptak J、Silliman N、Szabo S、Buckhaults P、Farrell C、Meeh P、Markowitz SD、Willis J、Dawson D、Willson JK、Gazdar AF、Hartigan J、Wu L、Liu C、Parmigiani G、Park BH、Bachman KE、Papadopoulos N、Vogelstein B、Kinzler KW、Velculescu VE:人类乳腺癌和结直肠癌的共识编码序列科学。2006 10月13日;314(5797):268-74。Epub 2006 9月7日。［文章］

药物的关系

药物的关系
DrugBank ID 的名字 药物组 药理作用? 行动 细节
DB00762 伊立替康 批准,临床实验 是的 抑制剂 细节
DB01030 Topotecan 批准,临床实验 是的 抑制剂 细节
DB04690 喜树碱 实验 未知的 抑制剂 细节
DB04882 Edotecarin 临床实验 未知的 细节
DB05129 Elsamitrucin 临床实验 未知的 细节
DB04967 Lucanthone 临床实验 是的 抑制剂 细节
DB05482 7-ethyl-10-hydroxycamptothecin 临床实验 未知的 细节
DB05806 Cositecan 临床实验 未知的 细节
DB06069 xmt - 1001 临床实验 未知的 细节
DB06159 Rubitecan 临床实验 未知的 细节
DB05630 钠stibogluconate 批准,临床实验 是的 抑制剂 细节
DB07354 2, 3-DIMETHOXY-12H - [1,3] DIOXOLO(5、6)INDENO [1, 2 c] ISOQUINOLIN-6-IUM 实验 未知的 细节
DB08159 4 - (5 11-DIOXO-5H-INDENO [1, 2 c] ISOQUINOLIN-6 (11 h) - yl) BUTANOATE 实验 未知的 细节
DB11254 己雷琐辛 批准 未知的 抑制剂 细节
DB14962 曲妥珠单抗deruxtecan 批准,临床实验 是的 抑制剂 细节
DB14962 曲妥珠单抗deruxtecan 批准,临床实验 未知的 抑制剂 细节
DB12893 Sacituzumab govitecan 批准,临床实验 是的 抑制剂 细节
DB00997 阿霉素 批准,临床实验 是的 抑制剂 细节
DB00970 放线菌素d 批准,临床实验 未知的 抑制剂 细节