DNA连接酶3

细节

的名字
DNA连接酶3
同义词
  • 6.5.1.1
  • DNA连接酶III
  • 聚脱氧核糖核酸合酶[ATP
基因名字
LIG3
生物
人类
氨基酸序列
bbb DNA连接酶3 MSLAFKIFFPQTLRALSRKELCLFRKHHWRDVRQFSQWSETDLLHGHPLFLRRKPVLSFQ gshlrsratylvflpglhvglcsgpcemaeqrfcvdyakrgtagckkkkkivkcrig KVVPNPFSESGGDMKEWYHIKCMFEKLERARATTKKIEDLTELEGWEELEDNEKEQITQH iadlsskaagtpkkkavvqakltttgqvtspkgasfvtstnprkfsgfsakpnnsgeap ssptpkrslssskcdprhkdcllrefrklcamvadnpsyntklllpgviktvynlndkqivklfsrifncnpddmardleqgsfppaakslltiqevdefllrskltkedeqqqalqdiasrctandlkciirlikhdlKmnsgakhvldaldpnayeafkasrnlqdvvervlhnaqevekepgqrralsvqaslmtp vqpmlaeacksveyamkkcpngmfseikydgervqvhkngdhfsyfsrsrslslllidnktgkplpfgvhkkaafqdanvclfvffdciyf ndvslmdrplcerrkflhdnmveipnrimfsemkrvtkaldladmitrvkkkdylnegamadtadlvvlgafygqgskipswlkvkiyypdfivpdpkkaa vweitgaefskseahtadgisirfprctrirddkdwksatpqlkelyqlskekadftv vagdegstttggsseenkgsavsrkapskpsastkegklsnsnskdgnmqtakpsAMKVGEKLATKSSPVKVGEKRKAADETLCQTKVLLDIFTGVRLYLPPSTPDFSRLRRYFV AFDGDLVQEFDMTSATHVLGSRDKNPAAQQVSPEWIWACIRKRRLVAPC
残差数
1009
分子量
112905.96
理论π
9.17
去分类
功能
ATP结合/DNA结合/DNA连接酶(ATP)活性/DNA连接酶活性/锌离子结合
流程
base-excision修复/碱基切除修复，DNA结扎/细胞周期/细胞分裂/DNA生物合成过程/DNA结扎/DNA修复/DNA复制/双股断裂修复/通过替代非同源端连接修复双股断裂/通过同源重组修复双链断裂/非同源端连接双股断裂修复/全基因组核苷酸切除修复/线粒体DNA修复/线粒体的组织/DNA重组的负调控/线粒体DNA复制的负调控/核苷酸切除修复/核苷酸切除修复，DNA间隙填充/转录偶联核苷酸切除修复
组件
DNA连接酶III-XRCC1复合体/线粒体/核浆/核/synaptonemal复杂
通用函数
锌离子结合
特定的功能
Isoform 3与细胞核内的DNA修复蛋白XRCC1作为异二聚体，可以纠正电离辐射和烷基化剂处理后的缺陷DNA断链修复和姐妹染色单体交换。Isoform 1靶向于线粒体，在线粒体碱基切除DNA修复中作为DNA连接酶(PubMed:10207110, PubMed:24674627)。
Pfam域函数
跨膜区
不可用
细胞的位置
线粒体
基因序列
>拼箱| BSEQ0009981 | DNA连接酶3 (LIG3) ATGTCTTTGGCTTTCAAGATCTTCTTTCCACAAACCCTCCGTGCACTCAGCCGAAAAGAA CTGTGCCTATTCCGAAAACATCACTGGCGTGATGTAAGACAATTCAGCCAGTGGTCAGAA ACAGATCTGCTTCATGGACATCCCCTCTTCCTGAGAAGAAAGCCTGTTCTATCATTCCAG GGAAGCCATCTAAGATCACGTGCCACCTACCTTGTTTTCTTGCCAGGGTTGCATGTGGGA CTCTGCAGTGGCCCCTGTGAGATGGCTGAGCAACGGTTCTGTGTGGACTATGCCAAGCGT GGCACAGCTGGCTGCAAAAAATGCAAGGAAAAGATTGTGAAGGGCGTATGCCGAATTGGC AAAGTGGTGCCCAATCCCTTCTCAGAGTCTGGGGGTGATATGAAAGAGTGGTACCACATTAAATGCATGTTTGAGAAACTAGAGCGGGCCCGGGCCACCACAAAAAAAATCGAGGACCTC ACAGAGCTGGAAGGCTGGGAAGAGCTGGAAGATAATGAGAAGGAACAGATAACCCAGCAC ATTGCAGATCTGTCTTCTAAGGCAGCAGGTACACCAAAGAAGAAAGCTGTTGTCCAGGCT AAGTTGACAACCACTGGCCAGGTGACTTCTCCAGTGAAAGGCGCCTCATTTGTCACCAGT ACCAATCCCCGGAAATTTTCTGGCTTTTCAGCCAAGCCCAACAACTCTGGGGAAGCCCCC TCGAGCCCCACCCCTAAGAGAAGTCTGTCTTCAAGCAAATGTGACCCCAGGCATAAGGAC TGTCTGCTACGGGAGTTTCGAAAGTTATGCGCCATGGTGGCCGATAATCCTAGCTACAAC ACGAAGACCCAGATCATCCAGGACTTCCTTCGGAAAGGCTCAGCAGGAGATGGTTTCCACGGTGATGTGTACCTAACAGTGAAGCTGCTGCTGCCAGGAGTCATTAAGACTGTTTACAAC TTGAACGATAAGCAGATTGTGAAGCTTTTCAGTCGCATTTTTAACTGCAACCCAGATGAT ATGGCACGGGACCTAGAGCAGGGTGACGTGTCAGAGACAATCAGAGTCTTCTTTGAGCAG AGCAAGTCTTTCCCCCCAGCTGCCAAGAGCCTCCTTACCATCCAGGAAGTGGATGAGTTC CTTCTGCGGCTGTCCAAGCTCACCAAGGAGGATGAGCAGCAACAGGCCCTACAGGACATT GCCTCCAGGTGTACAGCCAATGACCTTAAATGCATCATCAGGTTGATCAAACATGATCTG AAGATGAACTCAGGTGCAAAACATGTGTTAGACGCCCTTGACCCCAATGCCTATGAAGCC TTCAAAGCCTCGCGCAACCTGCAGGATGTGGTGGAGCGGGTCCTTCACAACGCGCAGGAGGTGGAGAAGGAGCCGGGCCAGAGACGAGCTCTGAGCGTCCAGGCCTCGCTGATGACACCT GTGCAGCCCATGTTGGCGGAGGCCTGCAAGTCCGTTGAGTATGCAATGAAGAAATGTCCC AATGGCATGTTCTCTGAGATCAAGTACGATGGAGAGCGAGTCCAGGTGCATAAGAATGGA GACCACTTCAGCTACTTCAGCCGCAGTCTCAAGCCCGTCCTTCCTCACAAGGTGGCCCAC TTTAAGGACTACATTCCCCAGGCTTTTCCTGGGGGCCACAGCATGATCTTGGATTCTGAA GTGCTTCTGATTGACAACAAGACAGGCAAACCACTGCCCTTTGGGACTCTGGGAGTACAC AAGAAAGCAGCCTTCCAGGATGCTAATGTCTGCCTGTTTGTTTTTGATTGTATCTACTTT AATGATGTCAGCTTGATGGACAGACCTCTGTGTGAGCGGCGGAAGTTTCTTCATGACAACATGGTTGAAATTCCAAACCGGATCATGTTCTCAGAAATGAAGCGAGTCACAAAAGCTTTG GACTTGGCTGACATGATAACCCGGGTGATCCAGGAGGGATTGGAGGGGCTGGTGCTGAAG GATGTGAAGGGTACATATGAGCCTGGGAAGCGGCACTGGCTGAAAGTGAAGAAAGACTAT TTGAACGAGGGGGCCATGGCCGACACAGCTGACCTGGTGGTCCTTGGAGCCTTCTATGGG CAAGGGAGCAAAGGCGGCATGATGTCAATCTTCCTCATGGGCTGCTACGACCCTGGCAGC CAGAAGTGGTGCACAGTCACCAAGTGTGCAGGAGGCCATGATGATGCCACGCTTGCCCGC CTGCAGAATGAACTAGACATGGTGAAGATCAGCAAGGACCCCAGCAAAATACCCAGCTGG TTGAAGGTCAACAAGATCTACTATCCTGACTTCATCGTCCCAGACCCAAAGAAAGCTGCCGTGTGGGAGATCACAGGGGCTGAATTCTCCAAATCGGAGGCTCATACAGCTGACGGGATC TCCATCCGATTCCCTCGCTGCACCCGAATCCGAGATGATAAGGACTGGAAATCTGCCACT AACCTTCCCCAACTCAAGGAACTGTACCAGTTGTCCAAGGAGAAGGCAGACTTCACTGTA GTGGCTGGAGATGAGGGGAGCTCCACTACAGGGGGTAGCAGTGAAGAGAATAAGGGTCCC TCAGGGTCTGCTGTGTCCCGCAAGGCCCCCAGCAAGCCCTCAGCCAGTACCAAGAAAGCA GAAGGGAAGCTGAGTAACTCCAACAGCAAAGATGGCAACATGCAGACTGCAAAGCCTTCC GCTATGAAGGTGGGGGAGAAGCTGGCCACAAAGTCTTCTCCAGTGAAAGTAGGGGAGAAG CGGAAAGCTGCTGATGAGACGCTGTGCCAAACAAAGAGGCGGCCAGCCAGTGAGCAGAGAGGAAGAACTGTGCCAGCAGGCAGGAGATAG
染色体的位置
17
轨迹
17 q11.2-q12
外部标识符
资源 链接
UniProtKB ID P49916
UniProtKB表项名称 DNLI3_HUMAN
GenBank蛋白ID 860963
基因ID X84740
GenAtlas ID LIG3
HGNC ID HGNC: 6600
一般引用
  1. 魏玉峰，Robins P, Carter K, Caldecott K, Pappin DJ, Yu GL, Wang RP, Shell BK, Nash RA, Schar P，等:DNA连接酶IV和DNA连接酶III的分子克隆与表达。Mol细胞生物学，1995 6;15(6):3206-16。［文章］
  2. 陈j, Tomkinson AE, Ramos W, Mackey ZB, danhower S, Walter CA, Schultz RA, Besterman JM, Husain I:哺乳动物DNA连接酶III:分子克隆、染色体定位及在精母细胞减数分裂重组中的表达。Mol细胞生物学，1995 10月;15(10):5412-22。［文章］
  3. 王w，沈p, Thiyagarajan S, Lin S, Palm C, Horvath R, Klopstock T, Cutler D, Pique L, Schrijver I, Davis RW, Mindrinos M, Speed TP, Scharfe C:利用改进的阵列测序技术鉴定线粒体疾病中罕见DNA变异。核酸研究，2011年1月;39(1):44-58。doi: 10.1093 / nar / gkq750。Epub 2010 9月15日。［文章］
  4. Zody MC,加伯M,亚当斯DJ,夏普T,耙J, Lupski JR,尼科尔森C,塞尔SM, Wilming L,年轻的SK, Abouelleil,艾伦NR, Bi W,布鲁姆T, Borowsky ML, Bugalter,巴特勒J, Chang杰,陈CK,做饭,乔鲁姆B,科莫CA,德容PJ, DeCaprio D,杜瓦K,菲茨杰拉德M,吉尔伯特J,吉布森R, Gnerre年代,戈尔茨坦,Grafham DV, Grocock R,哈菲兹N, Hagopian DS,哈特E,诺曼·CH Humphray年代,贾菲DB,琼斯M, Kamal M, Khodiyar VK、LaButti K, Laird G, Lehoczky J,刘X, Lokyitsang T, Loveland J,Lui A, Macdonald P, Major JE, Matthews L, Mauceli E, McCarroll SA, Mihalev AH, Mudge J, Nguyen C, Nicol R, O'Leary SB, Osoegawa K, Schwartz DC, Shaw-Smith C, Stankiewicz P, Steward C, Swarbreck D, Venkataraman V, Whittaker CA, Yang X, Zimmer AR, Bradley A, Hubbard T, Birren BW, Rogers J, Lander ES, Nusbaum C:人类17号染色体的DNA序列和人类谱系中的重排分析。自然科学。2006年4月20日;440(7087):1045-9。［文章］
  5. Gerhard DS,瓦格纳L,法因戈尔德EA, Shenmen厘米,松鸡LH,舒勒克,克莱因SL,古老的年代,Rasooly R, P,盖伊M,派克,Derge詹,Lipman D,科林斯FS,张成泽W,雪莉,Feolo M, Misquitta L,李E, Rotmistrovsky K, Greenhut科幻,Schaefer CF, Buetow K,邦纳TI, Haussler D,肯特J Kiekhaus M,弗瑞T,布伦特M, Prange C,施赖伯K,夏皮罗N, Bhat NK,霍普金斯射频,Hsie F,德里斯科尔T,苏亚雷斯MB, Casavant TL, Scheetz TE, Brown-stein MJ, Usdin结核病,年代,Toshiyuki Carninci P,朴Y, Dudekula DB,柯女士,川上K,铃木Y, Sugano年代,格鲁伯CE、史密斯先生,西蒙斯B,摩尔T,沃特曼R,约翰逊SL,阮Y,魏CL, Mathavan年代,Gunaratne PH值,吴J,加西亚,Hulyk西南,Fuh E,元Y,德,Kowis C,霍奇森,Muzny DM,麦克弗森J,吉布斯RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M,马丹,罗德里格斯年代,桑切斯,鳕鱼,Madari,年轻的AC, Wetherby KD,花岗岩SJ,邝PN,布林克利CP,皮尔森RL, Bouffard GG, Blakesly RW,绿色ED,迪克森MC,罗德里格斯AC, Grimwood J,污物J,迈尔斯RM,Butterfield YS, Griffith M, Griffith OL, Krzywinski MI, Liao N, Morin R, Palmquist D, Petrescu AS, Skalska U, Smailus DE, Stott JM, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Holt RA, Baross A, Marra MA, Clifton S, Makowski KA, Bosak S, Malek J: NIH全长cDNA项目:哺乳动物基因收集(MGC)的现状、质量和扩展。Genome res 2004 10月;14(10B):2121-7。［文章］
  6. Lakshmipathy U, Campbell C:人类DNA连接酶III基因编码细胞核和线粒体蛋白质。Mol细胞生物学1999 5月;19(5):3869-76。［文章］
  7. Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M:信号网络中的全局、体内和位点特异性磷酸化动力学。Cell. 2006年11月3日;127(3):635-48。［文章］
  8. Beausoleil SA, Villen J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP:一种基于概率的高通量蛋白质磷酸化分析和位点定位方法。生物技术学报。2006 10月;24(10):1285-92。Epub 2006 9月10日。［文章］
  9. 周春梅，周春梅，张志刚，张志刚，张志刚。有丝分裂磷酸化的定量图谱研究。中国科学院学报(自然科学版)，2008年8月5日，26(3):339 - 344。doi: 10.1073 / pnas.0805139105。Epub 2008年7月31日。［文章］
  10. Gauci S, Helbig AO, Slijper M, Krijgsveld J, Heck AJ, Mohammed S: Lys-N和胰蛋白酶以一种基于精细scx的方法覆盖磷酸蛋白组的互补部分。《肛肠化学》2009年6月1日;81(11):4493-501。doi: 10.1021 / ac9004309。［文章］
  11. Mayya V, Lundgren DH, Hwang SI, Rezaul K, Wu L, Eng JK, Rodionov V, Han DK: T细胞受体信号的定量磷酸化蛋白质组学分析揭示了蛋白质-蛋白质相互作用的全系统调节。科学通报。2009 8月18日;2(84):ra46。doi: 10.1126 / scisignal.2000007。［文章］
  12. Olsen JV, Vermeulen M, Santamaria A, Kumar C, Miller ML, Jensen LJ, Gnad F, Cox J, Jensen TS, Nigg EA, Brunak S, Mann M:定量磷酸化蛋白组学揭示了有丝分裂过程中广泛的完全磷酸化位点占据。科学通报。2010年1月12日;3(104):ra3。doi: 10.1126 / scisignal.2000475。［文章］
  13. Burkard TR, Planyavsky M, Kaupe I, Breitwieser FP, Burckstummer T, Bennett KL, Superti-Furga G, Colinge J:人类中心蛋白质组的初步表征。BMC系统生物学。2011年1月26日;5:17。doi: 10.1186 / 1752-0509-5-17。［文章］
  14. Rigbolt KT, Prokhorova TA, Akimov V, Henningsen J, Johansen PT, Kratchmarova I, Kassem M, Mann M, Olsen JV, Blagoev B:人胚胎干细胞分化过程中蛋白质组和磷蛋白组的全系统时间特征。科学信号。2011 3月15日;4(164):rs3。doi: 10.1126 / scisignal.2001570。［文章］
  15. Akbari M, Keijzers G, Maynard S, Scheibye-Knudsen M, Desler C, Hickson ID, Bohr VA:线粒体DNA连接酶III过表达保护细胞抗氧化应激，改善线粒体DNA碱基切除修复。DNA修复(Amst)。2014年4月,16:44-53。doi: 10.1016 / j.dnarep.2014.01.015。Epub 2014年2月27日。［文章］
  16. Thornton KH, Krishnan VV, West MG, Popham J, Ramirez M, Thelen MP, Cosman M:人DNA连接酶iii α BRCT结构域的表达、纯化和生物物理特征。中国生物医学工程学报。2001 4月;21(3):401-11。［文章］
  17. 杨建平，杨建平，李建平:DNA连接酶锌指结构域的溶解结构及其与DNA的结合。中华分子生物学杂志，2004 8月13日;341(3):723-38。［文章］
  18. Cotner-Gohara E, Kim IK, Hammel M, Tainer JA, Tomkinson AE, Ellenberger T:人DNA连接酶III通过在两个DNA结合状态之间动态切换来识别DNA末端。生物化学，2010年7月27日;49(29):6165-76。doi: 10.1021 / bi100503w。［文章］
  19. Cuneo MJ, Gabel SA, Krahn JM, Ricker MA, London RE: XRCC1/DNA连接酶iii - α brct介导的二聚体复合物的结构基础。核酸研究，2011年9月1日;39(17):7816-27。doi: 10.1093 / nar / gkr419。Epub 2011年6月7日。［文章］
  20. Sjoblom T, Jones S, Wood LD, Parsons DW, Lin J, Barber TD, Mandelker D, Leary RJ, Ptak J, Silliman N, Szabo S, Buckhaults P, Farrell C, Meeh P, Markowitz SD, Willis J, Dawson D, Willson JK, Gazdar AF, Hartigan J, Wu L, Liu C, Parmigiani G, Park BH, Bachman KE, Papadopoulos N, Vogelstein B, Kinzler KW, Velculescu VE:人类乳腺癌和结直肠癌的共识编码序列。科学，2006年10月13日;314(5797):268-74。Epub 2006 9月7日。［文章］

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