异质核核糖核蛋白D0

细节

的名字
异质核核糖核蛋白D0
同义词
  • 富au元素rna结合蛋白1
  • AUF1
  • hnRNP D0
  • HNRPD
基因名字
HNRNPD
生物
人类
氨基酸序列
bseqfggdgaaaaataavggsageqegamvaatqgaaaaagsgaggggtasggteggs AESEGAKIDASKNEEDEGHSNSSPRHSEAATAQREEWKMFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKF GEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEP VKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIM ekkyhnvglskceikvamskeqyqqqqqwggsrggfagragargrgggpsqnwnqgysnywnq gygnygygkvsrrrgggggqgggvsrrrggqqggggqgggqgggvsrrgggqqggggqggvsrrgggqqgggqggvsrrgggqqgggqggvsrrgggqqggggqggvsrrgggqqgggqggvsrrgggqqgggqggvsrrgggqqgggqggvsrrgggqqgggggqggvsrrgggqqgggggqggvsrrgggqqgggggqggvsrrgggqqggggqggvsrrggggqqggvsrrgghqqnsykpy
残差数
355
分子量
38434.09
理论π
不可用
去分类
功能
AT DNA结合/染色质绑定/组蛋白脱乙酰酶结合/mRNA 3'-UTR AU-rich区域结合/核糖核酸绑定/端粒DNA结合/转录因子结合
流程
3'- utr介导的mRNA不稳定/细胞对氨基酸刺激的反应/细胞对雌二醇刺激的反应/细胞对一氧化氮的反应/细胞对腐胺的反应/小脑发展/翻译的昼夜节律调节/基因表达/肝细胞去分化/肝脏发展/mRNA剪接，通过剪接体/信使rna稳定/RNA聚合酶II启动子的mRNA转录/基因表达的正向调控/端粒酶RNA逆转录酶活性的正向调控/端粒封盖的正向调控/转录的正向调控，dna模板/翻译的积极规制/昼夜节律调节/mRNA稳定性调控/端粒维持的调节/转录调控，dna模板化/钙离子反应/药物反应/电刺激反应/对雷帕霉素的反应/对磷酸钠的反应/RNA分解代谢过程/RNA加工/转录,dna模板
组件
胞质/细胞外的外来体/细胞内核糖核蛋白复合物/核浆/核
通用函数
与许多原癌基因和细胞因子mrna的3'-UTR中含有AU-rich elements (AREs)的RNA分子具有高亲和力。也以特定的方式结合到双链和单链DNA序列，并发挥转录因子的功能。每个rna结合域都能特异性地仅与单链非单调的5'- uag -3'序列结合，对单链5'-TTAGGG-3'端粒DNA重复的结合也较弱。与端粒单链DNA 5'-TTAGGG-3'重复序列相比，5'-UUAGGG-3'重复序列更紧密地结合RNA寡核苷酸。RRM1与DNA的结合抑制了DNA四重结构的形成，这可能在端粒伸长中起作用。可能参与翻译偶联的mRNA翻转。与其他rna结合蛋白一起参与由主要编码区不稳定性决定因素(mCRD)域介导的FOS mRNA的细胞质去化/翻译和衰变相互作用。可能在调节生物钟核心基因的节律性表达中起作用。直接与CRY1 mRNA的3'UTR结合，诱导CRY1有节奏的翻译。也可能参与PER2翻译的调节。
特定的功能
在dna结合处
Pfam域函数
跨膜区
不可用
细胞的位置
核
基因序列
>拼箱| BSEQ0049910 |异构核核糖核蛋白D0 (HNRNPD) ATGTCGGAGGAGCAGTTCGGCGGGGACGGGGCGGCGGCAGCGGCAACGGCGGCGGTAGGC GGCTCGGCGGGCGAGCAGGAGGGAGCCATGGTGGCGGCGACACAGGGGGCAGCGGCGGCG GCGGGAAGCGGAGCCGGGACCGGGGGCGGAACCGCGTCTGGAGGCACCGAAGGGGGCAGC GCCGAGTCGGAGGGGGCGAAGATTGACGCCAGTAAGAACGAGGAGGATGAAGGCCATTCA AACTCCTCCCCACGACACTCTGAAGCAGCGACGGCACAGCGGGAAGAATGGAAAATGTTT ATAGGAGGCCTTAGCTGGGACACTACAAAGAAAGATCTGAAGGACTACTTTTCCAAATTT GGTGAAGTTGTAGACTGCACTCTGAAGTTAGATCCTATCACAGGGCGATCAAGGGGTTTTGGCTTTGTGCTATTTAAAGAATCGGAGAGTGTAGATAAGGTCATGGATCAAAAAGAACAT AAATTGAATGGGAAGGTGATTGATCCTAAAAGGGCCAAAGCCATGAAAACAAAAGAGCCG GTTAAAAAAATTTTTGTTGGTGGCCTTTCTCCAGATACACCTGAAGAGAAAATAAGGGAG TACTTTGGTGGTTTTGGTGAGGTGGAATCCATAGAGCTCCCCATGGACAACAAGACCAAT AAGAGGCGTGGGTTCTGCTTTATTACCTTTAAGGAAGAAGAACCAGTGAAGAAGATAATG GAAAAGAAATACCACAATGTTGGTCTTAGTAAATGTGAAATAAAAGTAGCCATGTCGAAG GAACAATATCAGCAACAGCAACAGTGGGGATCTAGAGGAGGATTTGCAGGAAGAGCTCGT GGAAGAGGTGGTGGCCCCAGTCAAAACTGGAACCAGGGATATAGTAACTATTGGAATCAAggctatggcaactatggatataacagccaaggttacggggaggatatgactac actggttacaacaactactatggatatggtgattagcaaccagcagagtggttatggg aaggtatccagggaggggtcatcaaaatagctacaaaccatactaa
染色体的位置
4
轨迹
4 q21.22
外部标识符
资源 链接
UniProtKB ID Q14103
UniProtKB表项名称 HNRPD_HUMAN
HGNC ID HGNC: 5036
一般引用
  1. Kajita Y, Nakayama J, Aizawa M, Ishikawa F: uag特异性RNA结合蛋白，异质核核糖核蛋白D0。2xRBD-Gly家族常见的模组结构和结合性能。中国生物化学杂志，1995年9月22日;［文章］
  2. Dempsey LA, Li MJ, DePace A, Bray-Ward P, Maizels N:人HNRPD基因座定位到4q21并编码一种高度保守的蛋白。基因组学。1998 5月1日;49(3):378-84。［文章］
  3. Ota T,铃木Y, Nishikawa T,大月T, Sugiyama T,老大R,若松,Hayashi K,佐藤H, Nagai K,木村K, Makita H,关根身上M,大林M, Nishi T, Shibahara T,田中T, Ishii年代,山本J,齐藤K,卡瓦依Y, Isono Y,中村Y, Nagahari K,村上K, Yasuda T, Iwayanagi T, Wagatsuma M,治广,Sudo H, Hosoiri T, Kaku Y, Kodaira H,近藤H,同样是十六米,高桥M,神田K, T横井,Furuya T,规划E, Omura Y,安倍K, Kamihara K, Katsuta N, K,佐藤Tanikawa M,山崎M,Ninomiya K, Ishibashi T,山下式H, Murakawa K,藤森K, Tanai H, Kimata M,渡边M, Hiraoka年代,千叶Y,石田年代,小野Y, Takiguchi年代,渡边,Yosida M, Hotuta T, Kusano J, K Kanehori, Takahashi-Fujii, Hara H,没有试图推高日圆,野村Y, Togiya年代,Komai F, Hara R,竹内K、M, Imose N,武藏野K,较H,大岛渚,佐佐木N, Aotsuka年代,Yoshikawa Y, Matsunawa H, Ichihara T, Shiohata N,佐年代,守屋年代,Momiyama H, Satoh N, Takami年代,遗体Y,分别铃木O,中川年代,Senoh,沟口健二H,转到Y,清水F, Wakebe H, Hishigaki H,渡边T, Sugiyama, Takemoto M,川上B,山崎M,渡边K, Kumagai, Itakura年代,Fukuzumi Y, Y藤森,Komiyama M,田代H, Tanigami,藤原T,小野T,山田K,藤井裕久Y, Ozaki K, Hirao M, Ohmori Y,川端康成,Hikiji T, Kobatake N, Inagaki H, Ikema Y, Okamoto年代,Okitani R,川上T,野口年代,伊藤T, Shigeta K, Senba T, Matsumura K, Y,只是美津浓T,森永M,佐佐木M, Togashi T, Oyama M,要么H,渡边,Komatsu T, Mizushima-Sugano J, Satoh T, Shirai Y, Takahashi Y, Nakagawa K, Okumura K, Nagase T, Nomura N, Kikuchi H, Masuho Y, Yamashita R, Nakai K, Yada T, Nakamura Y, Ohara O, Isogai T, Sugano S: 21,243个全长人类cdna的完整测序和描述。中国科学。2004年1月;36(1):40-5。Epub 2003 12月21日。［文章］
  4. Hillier LW,坟墓助教,富尔顿RS,富尔顿,Pepin KH的风骚女子P, Wagner-McPherson C, D门外汉,威利K, Sekhon M,贝克尔MC,周期,Delehaunty KD,矿工TL,纳什,Kremitzki C项L, Du H, H, Bradshaw-Cordum H,阿里•J卡特J, Cordes M,哈里斯,伊萨克,van冲击,阮C, Du F,考特尼L, Kalicki J, Ozersky P,雅培,阿姆斯特朗J,嘹亮的歌EA,卡鲁索L, Cedroni M,棉花,戴维森T,德赛,艾略特G, Erb T, Fronick C, Gaige T, Haakenson W, Haglund K,福尔摩斯,哈金斯R,金正日K, Kruchowski党卫军,强劲的厘米,Grewal编写N, Goyea E,侯年代,征收,Martinka年代,米德K, McLellan医学博士Meyer R, Randall-Maher J,汤姆林森C, Dauphin-Kohlberg年代,Kozlowicz-Reilly,沙N, Swearengen-Shahid年代,斯奈德J,强大的JT,汤普森J,约克姆县发生M,伦纳德年代,Pearman C, Trani L, Radionenko M, Waligorski我,王C,摇滚SM Tin-Wollam, Maupin R,有P, Wendl MC,杨SP,波尔C,沃利斯JW, Spieth J, Bieri助教,Berkowicz N,纳尔逊•乔奥斯本J,丁L, Meyer R, Sabo, Shotland Y,Sinha P, Wohldmann PE, Cook LL, Hickenbotham MT, Eldred J, Williams D, Jones TA, She X, Ciccarelli FD, Izaurralde E, Taylor J, Schmutz J, Myers RM, Cox DR, Huang X, McPherson JD, Mardis ER, Clifton SW, Warren WC, Chinwalla AT, Eddy SR, Marra MA, Ovcharenko I, Furey TS, Miller W, Eichler EE, Bork P, Suyama M, Torrents D, Waterston RH, Wilson RK:人类染色体2号和4号DNA序列的生成和注释。《自然》2005年4月7日;434(7034):724-31。［文章］
  5. Gerhard DS,瓦格纳L,法因戈尔德EA, Shenmen厘米,松鸡LH,舒勒克,克莱因SL,古老的年代,Rasooly R, P,盖伊M,派克,Derge詹,Lipman D,科林斯FS,张成泽W,雪莉,Feolo M, Misquitta L,李E, Rotmistrovsky K, Greenhut科幻,Schaefer CF, Buetow K,邦纳TI, Haussler D,肯特J Kiekhaus M,弗瑞T,布伦特M, Prange C,施赖伯K,夏皮罗N, Bhat NK,霍普金斯射频,Hsie F,德里斯科尔T,苏亚雷斯MB, Casavant TL, Scheetz TE, Brown-stein MJ, Usdin结核病,年代,Toshiyuki Carninci P,朴Y, Dudekula DB,柯女士,川上K,铃木Y, Sugano年代,格鲁伯CE、史密斯先生,西蒙斯B,摩尔T,沃特曼R,约翰逊SL,阮Y,魏CL, Mathavan年代,Gunaratne PH值,吴J,加西亚,Hulyk西南,Fuh E,元Y,德,Kowis C,霍奇森,Muzny DM,麦克弗森J,吉布斯RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M,马丹,罗德里格斯年代,桑切斯,鳕鱼,Madari,年轻的AC, Wetherby KD,花岗岩SJ,邝PN,布林克利CP,皮尔森RL, Bouffard GG, Blakesly RW,绿色ED,迪克森MC,罗德里格斯AC, Grimwood J,污物J,迈尔斯RM,Butterfield YS, Griffith M, Griffith OL, Krzywinski MI, Liao N, Morin R, Palmquist D, Petrescu AS, Skalska U, Smailus DE, Stott JM, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Holt RA, Baross A, Marra MA, Clifton S, Makowski KA, Bosak S, Malek J: NIH全长cDNA项目:哺乳动物基因收集(MGC)的现状、质量和扩展。Genome res 2004 10月;14(10B):2121-7。［文章］
  6. Lahiri DK, Thomas JO: hnRNP C蛋白的cDNA克隆及其与单链DNA结合蛋白UP2的同源性。核酸决议1986年5月27日;14(10):4077-94。［文章］
  7. Tolnay M, Vereshchagina LA, Tsokos GC:异质核核糖核蛋白D0B是一种序列特异性dna结合蛋白。生物化学学报，1999年3月1日;338 (Pt 2):417-25。［文章］
  8. 陈晓东，任晓东，陈晓东:乙型肝炎病毒增强子II转录激活子c样蛋白的鉴定与克隆。中国病毒学杂志，1992 12月;66(12):6841-8。［文章］
  9. Ishikawa F, Matunis MJ, Dreyfuss G, Cech TR:结合pre-mRNA 3'剪接位点序列r(UUAG/G)和人类端粒DNA序列d(TTAGGG)n的核蛋白Mol细胞生物学，1993 7月;13(7):4301-10。［文章］
  10. Wagner BJ, DeMaria CT, Sun Y, Wilson GM, Brewer G:人AUF1基因的结构和基因组组织:替代pre-mRNA剪接产生四种蛋白质异构体。基因组学。1998年3月1日;48(2):195-202。［文章］
  11. Grosset C, Chen CY, Xu N, Sonenberg N, Jacquemin-Sablon H, Shyu AB:一种翻译偶联mRNA翻转的机制:poly(A)尾与C -fos RNA编码决定因子通过蛋白质复合物的相互作用。Cell 2000 9月29日;103(1):29-40。［文章］
  12. 王晓明，王晓明，王晓明，等。mRNA结合蛋白AUF1的基因表达及其与基因间相互作用的研究。中国生物医学工程学报，2001,24(3):344 - 344。［文章］
  13. 王晓明，王晓明，王晓明，等:高甲基硅氧烷在体内甲基化位点的鉴定与定量。化学方法。2004年11月1(2):119-26。Epub 2004 10月21日。［文章］
  14. Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M:信号网络中的全局、体内和位点特异性磷酸化动力学。Cell. 2006年11月3日;127(3):635-48。［文章］
  15. Jonson L, Vikesaa J, Krogh A, Nielsen LK, Hansen Tv, Borup R, Johnsen AH, Christiansen J, Nielsen FC: IMP1核糖核蛋白颗粒的分子组成。《Mol Cell Proteomics》2007年5月;6(5):798-811。Epub 2007年2月7日。［文章］
  16. 刘志刚，李志刚，李志刚，李志刚，李志刚，等。应用氧化钛富集法对原代人T淋巴细胞磷酸化水平进行分析。蛋白质组学杂志，2008年12月;7(12):5167-76。［文章］
  17. Daub H, Olsen JV, Bairlein M, Gnad F, Oppermann FS, Korner R, Greff Z, Keri G, Stemmann O, Mann M:激酶选择性富集使激酶组在细胞周期内的定量磷酸化蛋白质组学成为可能。Mol Cell, 2008 8月8日;31(3):438-48。doi: 10.1016 / j.molcel.2008.07.007。［文章］
  18. 周春梅，周春梅，张志刚，张志刚，张志刚。有丝分裂磷酸化的定量图谱研究。中国科学院学报(自然科学版)，2008年8月5日，26(3):339 - 344。doi: 10.1073 / pnas.0805139105。Epub 2008年7月31日。［文章］
  19. 韩刚，叶敏，周宏，蒋欣，冯松，蒋欣，田瑞，万东，邹宏，顾娟:强阴离子交换层析富集分离磷酸肽的大规模人肝组织磷蛋白组分析。蛋白质组学，2008年4月;8(7):1346-61。doi: 10.1002 / pmic.200700884。［文章］
  20. Gauci S, Helbig AO, Slijper M, Krijgsveld J, Heck AJ, Mohammed S: Lys-N和胰蛋白酶以一种基于精细scx的方法覆盖磷酸蛋白组的互补部分。《肛肠化学》2009年6月1日;81(11):4493-501。doi: 10.1021 / ac9004309。［文章］
  21. Oppermann FS, Gnad F, Olsen JV, Hornberger R, Greff Z, Keri G, Mann M, Daub H:人类kinome的大规模蛋白质组学分析。Mol Cell Proteomics, 2009 july;8(7):1751-64。doi: 10.1074 / mcp.M800588-MCP200。Epub 2009年4月15日［文章］
  22. Mayya V, Lundgren DH, Hwang SI, Rezaul K, Wu L, Eng JK, Rodionov V, Han DK: T细胞受体信号的定量磷酸化蛋白质组学分析揭示了蛋白质-蛋白质相互作用的全系统调节。科学通报。2009 8月18日;2(84):ra46。doi: 10.1126 / scisignal.2000007。［文章］
  23. Choudhary C, Kumar C, Gnad F, Nielsen ML, Rehman M, Walther TC, Olsen JV, Mann M:赖氨酸乙酰化靶向蛋白复合物并共同调节主要细胞功能。科学学报。2009年8月14日;325(5942):834-40。doi: 10.1126 / science.1175371。Epub 2009 7月16日。［文章］
  24. Olsen JV, Vermeulen M, Santamaria A, Kumar C, Miller ML, Jensen LJ, Gnad F, Cox J, Jensen TS, Nigg EA, Brunak S, Mann M:定量磷酸化蛋白组学揭示了有丝分裂过程中广泛的完全磷酸化位点占据。科学通报。2010年1月12日;3(104):ra3。doi: 10.1126 / scisignal.2000475。［文章］
  25. Burkard TR, Planyavsky M, Kaupe I, Breitwieser FP, Burckstummer T, Bennett KL, Superti-Furga G, Colinge J:人类中心蛋白质组的初步表征。BMC系统生物学。2011年1月26日;5:17。doi: 10.1186 / 1752-0509-5-17。［文章］
  26. Woo KC, Kim TD, Lee KH, Kim DY, Kim S, Lee HR, Kang HJ, Chung SJ, Senju S, Nishimura Y, Kim KT: gtp结合蛋白1 (GTPBP1)与其靶mRNA相互作用调节外泌体介导的mRNA转换。FASEB J. 2011年8月;25(8):2757-69。doi: 10.1096 / fj.10 - 178715。Epub 2011年4月22日。［文章］
  27. Rigbolt KT, Prokhorova TA, Akimov V, Henningsen J, Johansen PT, Kratchmarova I, Kassem M, Mann M, Olsen JV, Blagoev B:人胚胎干细胞分化过程中蛋白质组和磷蛋白组的全系统时间特征。科学信号。2011 3月15日;4(164):rs3。doi: 10.1126 / scisignal.2001570。［文章］
  28. 周华，Di Palma S, Preisinger C, Peng M, Polat AN, Heck AJ, Mohammed S:人类癌细胞磷蛋白组的综合表征。蛋白质组学报，2013年1月4日;12(1):260-71。doi: 10.1021 / pr300630k。Epub 2012 12月18日。［文章］
  29. 边艳，宋超，程凯，董敏，王芳，黄娟，孙东，王玲，叶敏，邹宏:酶辅助RP-RPLC方法深入分析人肝脏磷蛋白组。蛋白质组学杂志，2014年1月16日;96:253-62。doi: 10.1016 / j.jprot.2013.11.014。Epub 2013年11月22日。［文章］
  30. Guo A, Gu H, Zhou J, Mulhern D, Wang Y, Lee KA, Yang V, Aguiar M, Kornhauser J, Jia X, Ren J, Beausoleil SA, Silva JC, Vemulapalli V, Bedford MT, Comb MJ:蛋白质甲基化的免疫亲和富集和质谱分析。Mol Cell Proteomics, 2014年1月;13(1):372-87。doi: 10.1074 / mcp.O113.027870。Epub 2013 10月15日。［文章］
  31. Lee KH, Kim SH, Kim HJ, Kim W, Lee HR, Jung Y, Choi JH, Hong KY, Jang SK, Kim KT: AUF1参与Cryptochrome1 mRNA降解和节奏翻译。核酸研究，2014年4月;42(6):3590-606。doi: 10.1093 / nar / gkt1379。Epub 2014年1月13日。［文章］
  32. Impens F, Radoshevich L, Cossart P, Ribet D: SUMO位点的映射和外部刺激诱导的SUMO化变化分析。中国科学院学报(自然科学版)，2014年8月26日;doi: 10.1073 / pnas.1413825111。Epub 2014年8月11日。［文章］
  33. 瓦卡·杰卡梅，李志刚，李志刚，李志刚，李志刚，李志刚，李志刚，王志刚，王志刚。人类线粒体蛋白质组的n端组分析。蛋白质组学。2015 july;15(14):2519-24。doi: 10.1002 / pmic.201400617。Epub 2015年6月8日。［文章］
  34. Nagata T, Kurihara Y, Matsuda G, Saeki J, Kohno T, Yanagida Y, Ishikawa F, Uesugi S, Katahira M: hnRNP D0 n端uag特异性RNA结合域的结构及其与RNA的相互作用。中华分子生物学杂志。1999 3月26日;287(2):221-37［文章］

药物的关系

药物的关系
DrugBank ID 的名字 药物组 药理作用? 行动 细节
DB11638 Artenimol 批准的，实验性的，研究的 未知的 配位体 细节