剪接因子3B亚基3

细节

的名字
剪接因子3B亚基3
同义词
  • KIAA0017
  • pre - mrna剪接因子SF3b 130 kDa亚基
  • SAP 130
  • SAP130
  • SF3b130
  • 剪接体相关蛋白130
  • STAF130
基因名字
SF3B3
生物
人类
氨基酸序列
剪接因素3B亚单位3 MFLYNLTLQRATGISFAIHGNFSGTKQQEIVVSRGKILELLRPDPNTGKVHTLLTVEVFG virslmafrltggtkdyivvgsdsgrivileyqpsknmfekihqetfgksgcrrivpgqsdkgravmisaiekqklvyilnrdaarltisspleahkantlvyhvvgvvrkysepleehgnflitvpg gsdgpsgvlicsenyyadndptgeaaantqqtltfyeldlglnhvvrkysepleehgnflitvpg gsdgpsgvlicsenyityknfgdqpdircpiprrrndlddpergmifvcvteirlkyfdtvpvaaamcvlktgflfvasefgnhylyq iahlgdddepefssampleegdtfffqqprplknlvlvdeldslspilfcqiadlanedtPqlyvacgrgprsslrvlrhglevsemavselpgnpnavwtvrrhiedefdayiivsfvn atlvlsigetveevtdsgflgttttptlscsllgddalvqvypdgirhiradkrvnewktpg kktivkcavnqrqvvialtggelvyfemdpsgqlneyterkemsadvvcmslanvppgeq rsrflavglvdntvriisldqqplsmqalpaqpeslcivildqngvllrtvldpvtgdlgsrpvklfrvrmqgqeavlamssrsw lsysyqsrfhltplsyetlefasgpvklfrvrmqgqeavlamstnqvafp lqytprkfvihpesnnliiietdhnayteatkaqrkmaeemveaagederaaaa afinlpesifgapkagngqwasvirvmnpiqgntltlqaafsvavcrfsntgEdwyvlvgvakdlilnprsvaggfvytyklvnngekleflhktpveevpaaiapfqgrvl igvgklvykkklrkcenkhianyisgiqtighrvivsdvqesfiwvrykrnenq liifaddtyprwvttaslldydtvagadkfgnicvvrlppntndevdedptgnkalwdrg llngasqkaevimnyhvgetvlslqkttlipggseslvyttlsggigilvpftshedhdf fqhvemhlrsehpplcgrdhlsfrsyyfpvknvidgdlceqfnsmepnkqknvseeldrt ppevskkledirtryaf
残差数
1217
分子量
135576.25
理论π
不可用
去分类
功能
蛋白质复合物结合/核糖核酸绑定
流程
信使rna加工/mRNA剪接，通过剪接体/蛋白质分解代谢过程的负调控/蛋白质复合物组装/RNA拼接/RNA剪接，通过酯交换反应
组件
催化步骤2剪接体/核仁/核浆/核/小核核糖核蛋白复合体/spliceosomal复杂/12型剪接体复合体
通用函数
pre-mRNA中U2 snRNP稳定结合到分支点序列(BPS)形成的'A'复合物组装所需要的剪接因子SF3B的亚基。分支位点上游的SF3A/SF3B复合物的序列独立结合是必不可少的，它可能将U2 snRNP锚定在pre-mRNA上。也可能参与“E”复合体的组装。也属于u12依赖的小剪接体，参与罕见类核pre-mRNA内含子的剪接。
特定的功能
蛋白质复合物结合
Pfam域函数
跨膜区
不可用
细胞的位置
核
基因序列
>拼箱| BSEQ0049754 |剪接因子3 b亚基3 (SF3B3) ATGTTTCTGTACAACTTAACCTTGCAGAGAGCCACTGGCATCAGCTTTGCCATTCATGGA AACTTTTCTGGAACCAAACAACAAGAAATTGTTGTTTCCCGTGGGAAGATCTTGGAGCTG CTTCGCCCAGACCCCAACACTGGCAAAGTACATACCCTACTCACTGTGGAAGTATTCGGT GTTATCCGGTCACTCATGGCCTTTAGGCTGACAGGTGGCACCAAAGACTACATTGTAGTT GGCAGTGACTCTGGTCGAATTGTTATTTTGGAATACCAGCCATCTAAGAATATGTTTGAG AAGATTCACCAAGAAACCTTTGGCAAGAGTGGATGCCGTCGCATCGTTCCTGGCCAGTTC TTAGCTGTGGATCCCAAAGGGCGAGCCGTTATGATTAGTGCCATTGAGAAACAGAAATTGGTGTATATTTTGAACAGAGATGCTGCAGCCCGACTTACCATTTCATCTCCCCTGGAAGCC CACAAAGCAAACACTTTAGTGTATCATGTAGTTGGAGTAGATGTCGGATTTGAAAATCCA ATGTTTGCTTGTCTGGAAATGGATTATGAGGAAGCAGACAATGATCCAACAGGGGAAGCA GCAGCTAATACCCAGCAGACACTTACTTTCTATGAGCTAGACCTTGGTTTAAATCATGTG GTCCGAAAATACAGTGAACCTTTGGAGGAACACGGCAACTTCCTTATTACAGTTCCAGGA GGGTCAGATGGTCCAAGTGGAGTACTGATCTGCTCTGAAAACTATATTACTTACAAGAAC TTTGGTGACCAGCCAGATATCCGCTGTCCAATTCCCAGGAGGCGGAATGACCTGGATGAC CCTGAAAGAGGAATGATTTTTGTCTGCTCTGCAACCCATAAAACCAAATCGATGTTCTTCTTTTTGGCTCAAACTGAGCAGGGAGATATCTTTAAGATCACTTTGGAGACAGATGAAGAT ATGGTTACTGAGATCCGGCTCAAATATTTTGATACTGTACCCGTTGCTGCTGCCATGTGT GTGCTTAAAACAGGGTTCCTTTTTGTAGCATCAGAATTTGGAAACCATTACTTATATCAA ATTGCACATCTTGGAGATGATGATGAAGAACCTGAGTTTTCATCAGCCATGCCTCTGGAA GAAGGAGACACATTCTTTTTTCAGCCAAGACCACTTAAAAACCTTGTGCTGGTTGATGAG TTGGACAGCCTCTCTCCCATTCTGTTTTGCCAGATAGCTGATCTGGCCAATGAAGATACT CCACAGTTGTATGTGGCCTGTGGTAGGGGACCCCGATCATCTCTGAGAGTCCTAAGACAT GGACTTGAGGTGTCAGAAATGGCTGTTTCTGAGCTACCTGGTAACCCCAACGCTGTCTGGACAGTGCGTCGACACATTGAAGATGAGTTTGATGCCTACATCATTGTGTCTTTCGTGAAT GCCACCCTAGTGTTGTCCATTGGAGAAACTGTAGAAGAAGTGACTGACTCTGGGTTCCTG GGGACCACCCCGACCTTGTCCTGCTCCTTATTAGGAGATGATGCCTTGGTGCAGGTCTAT CCAGATGGCATTCGGCACATACGAGCAGACAAGAGAGTCAATGAGTGGAAGACCCCTGGA AAGAAAACAATTGTGAAGTGTGCAGTGAACCAGCGACAAGTGGTGATTGCCCTGACAGGA GGAGAGCTGGTCTATTTCGAGATGGATCCTTCAGGACAGCTGAATGAGTACACAGAACGG AAGGAGATGTCAGCAGATGTGGTGTGCATGAGTCTGGCCAATGTACCCCCTGGAGAGCAG CGGTCTCGCTTCCTGGCTGTGGGGCTTGTGGACAACACTGTCAGAATCATCTCCCTGGATCCCTCAGACTGTTTGCAACCTCTAAGCATGCAGGCTCTCCCAGCCCAGCCTGAGTCCTTG TGTATCGTGGAAATGGGTGGGACTGAGAAGCAGGATGAGCTGGGTGAGAGGGGCTCGATT GGCTTCCTATACCTGAATATTGGGCTACAGAACGGTGTGCTGCTGAGGACTGTCTTGGAC CCTGTCACTGGGGATTTGTCTGATACTCGCACTCGGTACCTGGGGTCCCGTCCTGTGAAG CTCTTCCGAGTCCGAATGCAAGGCCAGGAGGCAGTATTGGCCATGTCAAGCCGCTCATGG TTGAGCTATTCTTACCAATCTCGCTTCCATCTCACCCCACTGTCTTACGAGACACTGGAA TTTGCATCGGGTTTTGCCTCGGAACAGTGTCCCGAGGGCATTGTGGCCATCTCCACCAAC ACCCTACGGATTTTGGCATTAGAGAAGCTCGGTGCTGTCTTCAATCAAGTAGCCTTCCCACTGCAGTACACACCCAGGAAATTTGTCATCCACCCTGAGAGTAACAACCTTATTATCATT GAAACGGACCACAATGCCTACACTGAGGCCACGAAAGCTCAGAGAAAGCAGCAGATGGCA GAGGAAATGGTGGAAGCAGCAGGGGAGGATGAGCGGGAGCTGGCCGCAGAGATGGCAGCA GCATTCCTCAATGAAAACCTCCCTGAATCCATCTTTGGAGCTCCCAAGGCTGGCAATGGG CAGTGGGCCTCTGTGATCCGAGTGATGAATCCCATTCAAGGGAACACACTGGACCTTGTC CAGCTGGAACAGAATGAGGCAGCTTTTAGTGTGGCTGTGTGCAGGTTTTCCAACACTGGT GAAGACTGGTATGTGCTGGTGGGTGTGGCCAAGGACCTGATACTAAACCCCCGATCTGTG GCAGGGGGCTTCGTCTATACTTACAAGCTTGTGAACAATGGGGAAAAACTGGAGTTTTTGCACAAGACTCCTGTGGAAGAGGTCCCTGCTGCTATTGCCCCATTCCAGGGGAGGGTGTTG ATTGGTGTGGGGAAGCTGTTGCGTGTCTATGACCTGGGAAAGAAGAAGTTACTCCGAAAA TGTGAGAATAAGCATATTGCCAATTATATCTCTGGGATCCAGACTATCGGACATAGGGTA ATTGTATCTGATGTCCAAGAAAGTTTCATCTGGGTTCGCTACAAGCGTAATGAAAACCAG CTTATCATCTTTGCTGATGATACCTACCCCCGATGGGTCACTACAGCCAGCCTCCTGGAC TATGACACTGTGGCTGGGGCAGACAAGTTTGGCAACATATGTGTGGTGAGGCTCCCACCT AACACCAATGATGAAGTAGATGAGGATCCTACAGGAAACAAAGCCCTGTGGGACCGTGGC TTGCTCAATGGGGCCTCCCAGAAGGCAGAGGTGATCATGAACTACCATGTCGGGGAGACGGTGCTGTCCTTGCAGAAGACCACGCTGATCCCTGGAGGCTCAGAATCACTTGTCTATACC ACCTTGTCTGGAGGAATTGGCATCCTTGTGCCATTCACGTCCCATGAGGACCATGACTTC TTCCAGCATGTGGAAATGCACCTGCGGTCTGAACATCCCCCTCTCTGTGGGCGGGACCAC CTCAGCTTTCGCTCCTACTACTTCCCTGTGAAGAATGTGATTGATGGAGACCTCTGTGAG CAGTTCAATTCCATGGAACCCAACAAACAAAAGAACGTCTCTGAAGAACTGGACCGAACC CCACCCGAAGTGTCCAAGAAACTCGAGGATATCCGGACCCGCTACGCCTTCTGA
染色体的位置
16
轨迹
16 q22.1
外部标识符
资源 链接
UniProtKB ID Q15393
UniProtKB表项名称 SF3B3_HUMAN
HGNC ID HGNC: 10770
一般引用
  1. Das BK, Xia L, Palandjian L, Gozani O, Chyung Y, Reed R:含有剪接体蛋白SAPs 49, 130, 145和155的蛋白质复合物的特征。Mol细胞生物学1999 10月;19(10):6796-802。［文章］
  2. Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S:未知人类基因编码序列的预测。一、通过对人未成熟髓系KG-1随机取样的cDNA克隆分析，推导出40个新基因(KIAA0001-KIAA0040)的编码序列。DNA Res. 1994;1(1):27-35。［文章］
  3. Gerhard DS,瓦格纳L,法因戈尔德EA, Shenmen厘米,松鸡LH,舒勒克,克莱因SL,古老的年代,Rasooly R, P,盖伊M,派克,Derge詹,Lipman D,科林斯FS,张成泽W,雪莉,Feolo M, Misquitta L,李E, Rotmistrovsky K, Greenhut科幻,Schaefer CF, Buetow K,邦纳TI, Haussler D,肯特J Kiekhaus M,弗瑞T,布伦特M, Prange C,施赖伯K,夏皮罗N, Bhat NK,霍普金斯射频,Hsie F,德里斯科尔T,苏亚雷斯MB, Casavant TL, Scheetz TE, Brown-stein MJ, Usdin结核病,年代,Toshiyuki Carninci P,朴Y, Dudekula DB,柯女士,川上K,铃木Y, Sugano年代,格鲁伯CE、史密斯先生,西蒙斯B,摩尔T,沃特曼R,约翰逊SL,阮Y,魏CL, Mathavan年代,Gunaratne PH值,吴J,加西亚,Hulyk西南,Fuh E,元Y,德,Kowis C,霍奇森,Muzny DM,麦克弗森J,吉布斯RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M,马丹,罗德里格斯年代,桑切斯,鳕鱼,Madari,年轻的AC, Wetherby KD,花岗岩SJ,邝PN,布林克利CP,皮尔森RL, Bouffard GG, Blakesly RW,绿色ED,迪克森MC,罗德里格斯AC, Grimwood J,污物J,迈尔斯RM,Butterfield YS, Griffith M, Griffith OL, Krzywinski MI, Liao N, Morin R, Palmquist D, Petrescu AS, Skalska U, Smailus DE, Stott JM, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Holt RA, Baross A, Marra MA, Clifton S, Makowski KA, Bosak S, Malek J: NIH全长cDNA项目:哺乳动物基因收集(MGC)的现状、质量和扩展。Genome res 2004 10月;14(10B):2121-7。［文章］
  4. Bechtel S, Rosenfelder H, Duda, Schmidt CP, Ernst U, Wellenreuther R, Mehrle A, Schuster C, Bahr A, Blocker H, Heubner D, Hoerlein A, Michel G, Wedler H, Kohrer K, Ottenwalder B, Poustka A, Wiemann S, Schupp I:德国cDNA Consortium的全orf克隆资源。BMC Genomics, 2007年10月31日;8:399。［文章］
  5. Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG:人STAGA复合物是一种染色质乙酰化转录辅激活剂，在体内与pre-mRNA剪接和DNA损伤结合因子相互作用。Mol细胞生物学2001 10月;21(20):6782-95。［文章］
  6. Gangloff YG, Pointud JC, Thuault S, Carre L, Romier C, Muratoglu S, Brand M, Tora L, Couderc JL, Davidson I: TFIID成分人类TAF(II)140和果蝇BIP2 (TAF(II)155)是酵母TAF(II)47的新的后生动物同源物，包含一个组蛋白折叠和一个PHD指。Mol细胞生物学，2001 8月;21(15):5109-21。［文章］
  7. Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Luhrmann R:新型SF3b和17S U2 snRNP蛋白的表征，包括人Prp5p同源物和SF3b死盒蛋白。EMBO J. 2002 9月16日;21(18):4978-88。［文章］
  8. Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ:适合三维结构分析的天然剪接体的纯化和表征。RNA。2002年4月,8(4):426 - 39。［文章］
  9. Golas MM, Sander B, Will CL, Luhrmann R, Stark H:多蛋白剪接因子SF3b的分子结构。科学，2003年5月9日;300(5621):980-4。［文章］
  10. Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Luhrmann R:人类18S U11/U12 snRNP含有一组在u2依赖剪接体中未发现的新蛋白。RNA。2004年6月,10(6):929 - 41。［文章］
  11. Burkard TR, Planyavsky M, Kaupe I, Breitwieser FP, Burckstummer T, Bennett KL, Superti-Furga G, Colinge J:人类中心蛋白质组的初步表征。BMC系统生物学。2011年1月26日;5:17。doi: 10.1186 / 1752-0509-5-17。［文章］
  12. Bienvenut WV, Sumpton D, Martinez A, Lilla S, Espagne C, Meinnel T, Giglione C:植物和哺乳动物蛋白质的比较大规模表征揭示了相似和特殊的n - α -乙酰化特征。Mol Cell Proteomics, 2012 Jun;11(6):M111.015131。doi: 10.1074 / mcp.M111.015131。Epub 2012 1月5日。［文章］
  13. Van Damme P, Lasa M, Polevoda B, Gazquez C, Elosegui-Artola, Kim DS, De Juan-Pardo E, Demeyer K, Hole K, Larrea E, Timmerman E, Prieto J, Arnesen T, Sherman F, Gevaert K, Aldabe R: n端乙酰基转移酶NatB的n端乙酰基组分析和功能分析。中国科学院学报(自然科学版)，2012年7月31日;doi: 10.1073 / pnas.1210303109。Epub 2012 7月18日。［文章］
  14. 周华，Di Palma S, Preisinger C, Peng M, Polat AN, Heck AJ, Mohammed S:人类癌细胞磷蛋白组的综合表征。蛋白质组学报，2013年1月4日;12(1):260-71。doi: 10.1021 / pr300630k。Epub 2012 12月18日。［文章］
  15. 边艳，宋超，程凯，董敏，王芳，黄娟，孙东，王玲，叶敏，邹宏:酶辅助RP-RPLC方法深入分析人肝脏磷蛋白组。蛋白质组学杂志，2014年1月16日;96:253-62。doi: 10.1016 / j.jprot.2013.11.014。Epub 2013年11月22日。［文章］

药物的关系

药物的关系
DrugBank ID 的名字 药物组 药理作用? 行动 细节
DB04216 槲皮素 实验,试验 未知的 细节